INGEBI 02650
INSTITUTO DE INVESTIGACIONES EN INGENIERIA GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR "DR. HECTOR N TORRES"
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
EN BÚSQUEDA DE GENES SELECCIONADOS POSITIVAMENTE EN EL
Autor/es:
PISCIOTTANO, F., A.B. ELGOYHEN, L.F. FRANCHINI
Lugar:
Bernal, Buenos Aires
Reunión:
Congreso; 1er Congreso Argentino de Bioinformática y Biología Computacional; 2010
Resumen:
A lo largo de la evolución, el oído interno de los mamíferos sufrió
cambios muy importantes que lo diferenciaron del órgano auditivo de los
demás vertebrados. Entre estos cambios se cuentan una importante
elongación de la papila que dio como resultado una cóclea en espiral,
característica de los mamíferos, la distribución particular y estable de
las células ciliadas a lo largo del órgano de Corti y el origen de un
linaje celular único, la célula ciliada externa. Este nuevo tipo celular
posee un novedoso mecanismo llamado electromotilidad somática. Este
mecanismo de amplificación mecánica, propio de los mamíferos, depende de
los cambios de longitud de las células ciliadas externas. Estos cambios
han dotado a los mamíferos de capacidades auditivas únicas dentro del
reino animal.
Existen ya evidencias de evolución adaptativa a nivel molecular de
proteínas que cumplen un importante papel en la audición de los mamíferos.
Nuestro objetivo es estudiar la evolución del trascriptoma completo de
este órgano en búsqueda de genes que se ajusten a un modelo de selección
positiva. Para esto estamos desarrollando una base de datos completa de lo
genes que se expresan exclusiva o preferencialmente en el oído interno a
partir de 17 bibliotecas de expresión de este órgano disponibles
públicamente que contienen en total 28,937 secuencias de expresión (ESTs).
El análisis evolutivo se realiza implementando tests de selección positiva
linje-sitio específicos que permiten encontrar, en aquellos genes que
ajustan a un modelo de evolución adaptativa, sitios en el alineamiento que
hayan evolucionado positivamente en el linaje particular que llevo a la
aparición de los mamíferos.
A partir del estudio de los 100 primeros ESTs de dos bibliotecas de
expresión de oído interno pudimos realizar un análisis automático
exploratorio de selección positiva sobre los 50 genes obtenido de la
primer biblioteca y los 34 genes obtenidos de la segunda. Como resultado
obtuvimos 10 genes en el primer caso y 9 en el segundo caso que
presentaban más de un 95% de probabilidades de ajustar a un modelo que
contempla selección positiva que a una hipótesis nula que restringe este
tipo de evolución para los sitios de las secuencias estudiadas.
