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En la laguna del Parque Sur (ciudad de Santa Fe), las floraciones de Cyanobacteria se observan de forma frecuente desde hace más de 40 años habiéndose estudiado en profundidad en tres momentos (años 1974, 2001, 2014). Este trabajo tuvo por objetivo describir la dinámica de los grupos dominantes de Cyanobacteria y su asociación con variaciones ambientales considerando los tres períodos muestreados en esta laguna urbana eutrofizada. Se tomaron muestras de fitoplancton y diferentes parámetros ambientales en la región pelágica del lago. Las muestras de fitoplancton fueron analizadas con la metodología de Utermöhl (1958) en todos los años. En el año 2014 también se tomaron muestras para el análisis de fósforo reactivo soluble (PRS), nitrato y amonio. Los tres grupos dominantes fueron Microcystis spp., Anabaenopsis arnoldii y Raphidiopsis spp. Microcystis spp. mostró una tendencia de disminución de las abundancias registradas a lo largo de los años con diferencias entre 1974 y los otros años (p< 0.05 en todos los casos), en tanto que A. arnoldii y Raphidiopsis spp. mostraron una tendencia de aumento con diferencias significativas entre 1974-2014 (p= 0.005 y p= 0.001, respectivamente) y 1974-2001 (solo Raphidiopsis spp., p= 0.00003).. El análisis de redundancia (F= 4.903 p= 0.002)) mostró que la temperatura (20.2%) y la conductividad (10.8%) fueron las variables con mayor poder explicativo demostrando los tres géneros una asociación positiva con ambas variables durante los años estudiados. Respecto de los nutrientes, las correlaciones de Spearman mostraron que Microcystis spp. y Raphidiopsis spp. se asociaron de forma negativa con la disponibilidad de amonio en tanto que el fitoplancton total con el PRS y nitrato a lo largo del año 2014 (Rho >(-0.70) p< 0.05 en todos los casos). La tendencia observada entre los tres años de muestreo es un aumento de la frecuencia de aparición y una disminución en el número de individuos registrados.