UFYMA   27844
UNIDAD DE FITOPATOLOGIA Y MODELIZACION AGRICOLA
Unidad Ejecutora - UE
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- Consultoría estadística(ST 5011)[+]Detalle STANSe brinda asesoramiento tanto en el diseño de estudios observacionales y experimentales como en el análisis de datos enmarcados en investigaciones científicas y desarrollos tecnológicos que se llevan a cabo en instituciones privadas y/o públicas y se encuentran relacionadas a las Ciencias Biológicas, Ciencias Agropecuarias, y Ciencias de la Salud.MetodologíaTrabajo conjunto con investigadores para la especificación de objetivos de análisis de datos, cooperación en la transformación de datos en conocimiento utilizando herramientas estadísticas apropiadas que son aplicadas con software estadístico de desarrollo propio (InfoStat, InfoGen), software libre (R) y software comercial (SAS). Capacitación personalizada en el análisis estadístico de bases de datos provistas por el consultor.Disciplina PrimariaMatemáticaDisciplina DesagregadaESTADISTICA-DISEOS MUESTRALES Y EXPERIMENTACampo de AplicaciónAgropecuarioActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p. | Procesamiento de datosPalabras ClaveModelación estadística
Biometría y Bioinformática
- Comportamiento de variedades de arroz frente a la infección por Rice stripe necrosis virus, causante del entorchamiento del arroz.(ST 5010)[+]Detalle STANLa evaluación de arroz frente a la infección por Rice stripe necrosis virus (RSNV) es realizada a partir de semillas y la transmisión del virus es por la utilización del vector Polymyxa graminis. Se hace la observación de síntomas en hojas, el diagnóstico serológico del virus y la constatación de la presencia de cistosoros de P. gramini en raíces. Los resultados son muy importantes para las semilleras y mejoradores de arroz, para la elección de las variedades resistentes al virus.Metodología1. Recepción de semillas provista por el contratante para producción de plantines. 2. Multiplicación del inóculo de P. graminis por la infección de raíces de arroz susceptible al RSNV. 3. Tratamiento de semillas de la variedad a evaluar con desinfectante para eliminar contaminantes. 4 Germinación en sistema hidropónico bajo condiciones controladas y registro del vigor de los plantines anteriormente a la inoculación. 5. Inoculación de con P. graminis y RSNV. 6. Observación y registro de síntomas y/o alteraciones en los plantines inoculados. 7. Registro fotográfico de los plantines. 6. Análisis serológico para la presencia de RSNV en hojas. 8. Observación de las raíces en microscopio óptico para la presencia de cistosoros. 9. Análisis de resultados obtenidos y redacción del informe final.Disciplina PrimariaCiencias AgrariasDisciplina DesagregadaAGRONOMIA Y DASONOMIA-FITOPATOLOGIACampo de AplicaciónProduccion vegetalActividad IndustrialCultivo de arrozPalabras Clavearroz
rice stripe necrosis virus
entorchamiento
resistencia
tolerancia
- Asesoramiento en análisis de expresión de genes en sistemas planta - patógeno(ST 5898)[+]Detalle STANSe brinda asesoramiento en la elaboración del protocolo para realizar la obtención de muestras en sistemas planta - patógeno y la preparación de las mismas para secuenciación masiva, y posterior análisis bioinformático, permitiendo conocer la expresión de genes tanto de la planta como del patógeno. Destinatarios: universidades, unidades ejecutoras, empresas con áreas de I+D.Metodología1) Entrevista con quien solicita el asesoramiento. 2) Elaboración y entrega de un protocolo escrito donde se detallará como realizar la recolección de muestras y la obtención de ARN. 3) Realización de la secuenciación por parte del interesado, o bien a través del STAN. En este último caso, el STAN subcontratará un servicio de secuenciación. 4) Realización de análisis bioinformáticoDisciplina PrimariaCiencias AgrariasDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-MICROBIOLOGIACampo de AplicaciónSanidad vegetalActividad IndustrialInvestigación y desarrollo experimental en el campo de las ciencias agropecuariasPalabras Claveinteracción planta patógeno
expresión génica
RNA seq
- Servicio de secuenciación de organismos por plataforma ONT(ST 7569)[+]Detalle STANSe realiza secuenciación de organismos utilizando la plataforma Oxford Nanopore Technologies (ONT), ideal para obtener datos genómicos de alta calidad en proyectos diversos. Incluye análisis bioinformático básico, que abarca desde el procesamiento inicial de las secuencias hasta la generación de reportes detallados, así como asesoramiento especializado en técnicas de secuenciación, destinado a investigadores, empresas y organismos públicos que buscan soluciones avanzadas en genómica aplicada.MetodologíaEl servicio comienza con el chequeo y control de calidad de los ácidos nucleicos proporcionados por el contratante o con el aislamiento in situ de los mismos. Posteriormente, se realiza la secuenciación de los ácidos nucleicos utilizando la plataforma Oxford Nanopore Technologies (ONT) en dispositivos MinION (M1kc, M1kb) . Se lleva a cabo la construcción de bibliotecas de secuenciación y análisis de calidad de los eventos obtenidos. A continuación, se realiza el ensamblado/mapeo de las secuencias, seguido de la anotación genómica, análisis filogenético e identificación de marcadores moleculares. El servicio incluye la entrega de un informe final que no remite carácter de certificación, que contiene las estadísticas generales de la secuenciación y un reporte detallado del análisis solicitado por el contratante. Todo el proceso se lleva a cabo bajo protocolos estandarizados para asegurar la reproducibilidad y calidad de los resultados.EquipamientoDispositivo de secuenciación portátil Oxford Mk1BDisciplina PrimariaBiologíaDisciplina DesagregadaFISICA-BIOLOGICACampo de AplicaciónProm.Gral.del Conoc.-Cs.Exactas y NaturalesActividad IndustrialCultivos perennes | Servicios para el control de plagas, baños parasiticidas, etc. | Cultivos temporalesPalabras ClaveGenómica
Secuenciación
Identificación
Bioinformatica
Biotecnología

