PERSONAL DE APOYO
BIGI Maria De Las Mercedes
datos académicos
Título/s
Doctora de la Universidad de Buenos Aires
Bioquimica
Categoría
PROFESIONAL ADJUNTO
Tarea
1. Búsqueda y análisis de expresión diferencial de genes transportadores ABC en bases de datos de expresión en células de cáncer de colon. Análisis de expresión diferencial comparando distintas condiciones en distintas líneas celulares y tumores de pacientes de cáncer de colon. A partir de datos de nivel de expresión de distintos estadios y agrupamientos de genes seleccionados, Generar gráficos Boxplot y cálculos estadísticos en R para ser incluidos en los resultados de un manuscrito a publicar. 2. Análisis de expresión de miRNAs a partir de datos de secuenciación masiva de miRNAseq y de las posibles vías metabólicas involucradas. Se analizarán de los miRNAs maduros (y otros small RNAs) expresados diferencialmente por la expresión de ACSL4 en el modelo de la línea MCF‐7 Tet‐Off/ACSL4, que sobre‐expresa ACSL4 en forma reprimible, comparándola con las células MCF‐7 Tet‐Off control. Se calculará de fold change y se realizará un análisis estadístico.Posteriormente se comparará el perfil obtenido con la expresión de miRNAs maduros obtenidos de tumores de mama.También se realizará el análisis predictivo de las posibles vías metabólicas o condiciones donde se expresan los miRNAS expresados diferencialmente utilizando diferentes bases de datos KEGG Pathway, WikiPathways, entre otras. ANPCYT (PICT 2021-GRF-TI-00258) 2023-2025: ?Mecanismos desencadenados por Acil-CoA sintetasa 4 en cáncer de mama: identificación y rol de microARNs?. Directora: Ana Fernanda Castillo 3. Análisis de enriquecimiento de vías metabólicas mitocondriales a partir de datos RNA-seq. Estudio a partir de set RNA-seq de expresión diferencial de línea celular estable MCF-7 Tet-Off / ACSL4 identificar las diferentes vías metabólicas mitocondriales podrían estar diferencialmente moduladas. Softwares propuesto para dicho análisis: Metaspace software. Posteriormente realizar la edición gráfica de los resultados para la posterior inclusión en un manuscrito a publicar. 4. Búsqueda en diferentes bases de datos públicas de mutaciones ACSL4 relacionadas con cáncer. Búsqueda de polimorfismos en tumores en bases de datos de secuenciación genómica. 5. Realización de cursos de capacitación. Curso de Bioinformática de 300 horas organizado por la WBDS LA (WOMAN IN BIOINFORMATICS AND DATA SCIENCE LA). Con curso de ingreso y examen de admisión al curso, exámenes y trabajo FINAL. Enero-Marzo de 2023 WCSC Cancer Genome Analysis - Latin America and the Caribbean, 26 November?1 December 2023. Beneficiada por beca según orden de mérito cubrir viajes, alojamiento y manutención.
Director
PIGOZZI, MARIA INES / INV INDEPENDIENTE
Lugar de trabajo
[INBIOMED] INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS -
[OCA - HOUSSAY] OFICINA DE COORDINACION ADMINISTRATIVA HOUSSAY -
[CONICET] CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS -