PERSONAL DE APOYO
CASAL juan Jose
datos académicos
Título/s
Doctor
Farmacéutico
Farmacéutico
Categoría
PROFESIONAL ASISTENTE
Tarea
Durante 2025 profundizaré líneas de trabajo que integran bioinformática, análisis de datos ómicos, dinámica molecular y ciencia abierta aplicada a la investigación biomédica. Uno de los ítems será el estudio transcriptómico mediante técnicas de RNA-seq, alineamiento con HISAT2 y análisis funcional con DESeq2 y clusterProfiler, se buscará caracterizar perfiles génicos diferenciales, identificar rutas sensibles a factores ambientales y proponer biomarcadores de respuesta, con miras a su validación experimental y complementariedad con estudios proteómicos.
Asimismo, avanzaré en una estrategia de análisis integrativo de datos transcriptómicos y proteómicos en modelos animales orientada a detectar alteraciones sinápticas tempranas. Se utilizarán ontologías GO para dirigir el análisis hacia funciones específicas vinculadas a la estructura y regulación sináptica, contrastando los resultados con datos humanos. El objetivo será afianzar este pipeline como herramienta reproducible para estudios traslacionales en neurodegeneración.
En paralelo, continuaré con el análisis computacional de permeabilidad en aquaporinas mediante simulaciones de dinámica molecular en GROMACS. Se aplicarán tensiones anisotrópicas a lo largo del eje Z y se cuantificarán eventos de cruce de moléculas de agua utilizando scripts desarrollados en Python sobre MDAnalysis. Este enfoque permitirá estimar permeabilidades osmótica y difusional, analizar la dinámica del poro proteico y evaluar la influencia de la tensión de membrana sobre las trayectorias moleculares.
También continuaré desarrollando metodologías para el análisis del comportamiento animal en moscas y ratones, integrando detección de poses con SLEAP, extracción automatizada de métricas temporales, clasificación con modelos de machine learning, análisis espectral y modelado de estados conductuales mediante HMM. Estos métodos serán aplicados a paradigmas de memoria espacial, con el fin de caracterizar fenotipos conductuales con alta resolución temporal y espacial.
En el ámbito formativo, continuaré brindando capacitación a pasantes e investigadores del IFIBIO en herramientas de análisis bioinformático, scripting en Python y R, procesamiento de imágenes y desarrollo de notebooks interactivos. También sostendré mis actividades docentes en la Universidad Católica Argentina, incorporando contenidos computacionales al dictado de materias del área de química orgánica.
Director
MURER, MARIO GUSTAVO / INV SUPERIOR
Lugar de trabajo
[IFIBIO HOUSSAY] INSTITUTO DE FISIOLOGIA Y BIOFISICA BERNARDO HOUSSAY -
[OCA - HOUSSAY] OFICINA DE COORDINACION ADMINISTRATIVA HOUSSAY -
[CONICET] CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS -
[OCA - HOUSSAY] OFICINA DE COORDINACION ADMINISTRATIVA HOUSSAY -
[CONICET] CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS -

