Revaloración de la información filogenética basada en la región ITS1-5.8S-ITS2 en cepas de Candida tropicalis

MADRASSI, LUCAS M.; ALVAREZ CECCO, PAULO; SALVATIERRA, KARINA

Congreso; XLVIII Congreso Argentino de Genética; 2020

Sociedad Argentina de Genética

El uso de especímenes anotados en banco de datos, ha permitido mejorar y estandarizar la metodología de identificación de especies por su variación genética. En micología, el gen de la subunidad 5.8S es considerado el locus estándar por excelencia. Está flanqueado por dos regiones internas espaciadoras (en inglés, ITS), que varían intraespecíficamente. A pesar de su poder como identificador especie-específico, pocos estudios han sido realizados para la mayoría de especies que conforman el género Candida, como por ejemplo C. tropicalis. Nuestra hipótesis de trabajo es que existen diferencias en cepas de C. tropicalis para la región ITS1-5.8-ITS2 de modo que las mismas pueden caracterizarse filogenéticamente. Nos propusimos estudiar la variación intraespecífica dentro de esta región, analizando y comparando la variación existente dentro y entre las cepas en relación a su origen geográfico y el tipo de muestra (ambiental o clínica). 1250 accesiones de C. tropicalis fueron descargadas del banco de datos genéticos de NCBI. Conservamos aquellas que contenían el segmento completo resultando en 795 secuencias finales. Se utilizó como grupo externo una secuencia de referencia de C. parapsilosis. Los árboles de haplotipos mostraron al menos tres grupos los cuales evidencian cambios en sitios puntuales entre ellos. Estos resultados concuerdan parcialmente lo obtenido por otros investigadores sobre la diversidad genética del locus ITS1-5.8S-ITS2, pero amplía el conocimiento de esta región para C. tropicalis.