INVESTIGADORES
CAPECE Luciana
congresos y reuniones científicas
Título:
Estudio Computacional de la interacción del óxido nítrico con citocromo c' y su relevancia para la guanilato ciclasa
Autor/es:
LUCIANA CAPECE; MARCELO A. MARTI; ALEJANDRO CRESPO; DARIO A. ESTRIN
Lugar:
Rosario
Reunión:
Workshop; Primer Workshop Argentino de Química Bioinorgánica; 2004
Institución organizadora:
Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario
Resumen:
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El citocromo
c´ es una hemoproteína de bacteria cuyas propiedades
espectroscópicas son similares a las de la guanilato ciclasa soluble
(sGC). Esta última es el único receptor conocido de óxido nítrico
y cataliza la conversión de GTP a GMPcíclico cuando se activa por
unión con óxido nítrico. A pesar de que no se cuenta con
información cristalográfica, se cree que la formación del complejo
pentacoordinado con NO (5c-NO) asociado a la ruptura del enlace
Fe-His constituye el disparador de un cambio conformacional que lleva
a la activación de la enzima y a la transducción de la señal del
NO.
Existen
evidencias experimentales que sugieren que la proteína citocromo
c´de Alcalignes xylosoxidans también forma el complejo 5c-NO.
Información cristalográdica reciente indica que en el mismo el NO
ocuparía el sitio proximal, lo que se ha propuesto también para
explicar el funcionamiento de la sGC.
Con el
objeto de obtener información microscópica respecto de este
fenómeno, se realizaron cálculos híbridos (QM-MM) a nivel DFT
utilizando el código SIESTA, bases de calidad doble zeta y el
funcional PBE.
Los
resultados obtenidos muestran que la formación del complejo 5c-NO en
cit c´ está favorecida por la presencia de un segundo mínimo con
la histidina no coordinada al Fe e interactuando con la Arg124. Po
rotra parte, la ruptura del enlace Fe-His puede ocurrir por dos
caminos, uno involucrando NO y el otro independiente de NO.
Finalmente, los resultados obtenidos muestran que la preferencia de
la cara proximal por el NO está dada por un efecto de repulsión
estérica con la Leu16 en la cara distal y por una interacción
favorable con la His120 y la Arg124 que permite la ruptura del enlace
Fe-His y la unión de NO en la cara proximal.
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