INVESTIGADORES
MARTINEZ SAYE Melisa Soledad
congresos y reuniones científicas
Título:
ESTRATEGIAS DE REPOSICIONAMIENTO IN SILICO DE DROGAS COMO INHIBIDORES DE LA NUCLEÓSIDO DIFOSFATO QUINASA 1 DE TRYPANOSOMA CRUZI
Autor/es:
GALCERAN F; MARTÍNEZ SAYÉ M; REIGADA C; PEREIRA CA; MIRANDA MR
Reunión:
Jornada; Jornadas de Investigadores en Formación en Ciencia y Tecnología; 2021
Institución organizadora:
Universidad Nacional de Quilmes
Resumen:
Las nucleósido difosfato quinasas (NDPKs) son enzimas que participan en la homeostasis intracelular de nucleótidos; se consideran multifuncionales ya que están involucradas en numerosos procesos claves para la supervivencia de las células. La TcNDPK1 es una isoforma del parásito Trypanosoma cruzi que es secretada, participa en mecanismos de resistencia a drogas tripanocidas, posee actividad nucleasa, se une a ácidos nucleicos e interviene en respuestas frente al daño al ADN. En los tripanosomátidos las NDPKs juegan un papel adicional en el salvataje y reciclado de bases nitrogenadas dado que no pueden sintetizar purinas de novo. Esta diferencia respecto de los hospedadores mamíferos hace que las NDPKs sean atractivos blancos moleculares para la búsqueda y diseño de fármacos contra dichos organismos. Además, no existen inhibidores potentes y específicos de estas enzimas descriptos hasta el momento en ningún organismo.En el presente trabajo iniciamos una búsqueda de posibles inhibidores de la TcNDPK1 mediante estrategias computacionales de reposicionamiento de drogas basadas tanto en el ligando (sustratos o inhibidores experimentales) como en el receptor (la proteína blanco). Para la estrategia basada en el receptor, partimos de la estructura tridimensional cristalizada de la TcNDPK1, considerando especialmente aquellos residuos y estructuras diferenciales entre ésta y la enzima humana. En dichos sitios se realizaron simulaciones de docking molecular con 12,000 compuestos aprobados para su uso en humanos. Para validar dicho proceso se llevó a cabo el cross-docking del sustrato utilizado por la enzima y se está realizando el docking molecular con diferentes softwares. En tanto a la metodología basada en el ligando, se realizó un cribado virtual utilizando programas de similitud estructural y química, teniendo como compuestos de referencia inhibidores conocidos obtenidos de la bibliografía y realizando la búsqueda en los 12,000 compuestos antes mencionados. Para validar la búsqueda se colocaron los inhibidores en las bases de datos utilizadas y los mismos, al finalizar el cribado, obtuvieron mejor puntaje de similitud.Mediante estos abordajes seleccionamos 40 compuestos, 24 de la estrategia basada en el ligando y 17 basados en el receptor, de los cuales la apomorfina, utilizada en el tratamiento de la enfermedad de Parkinson, y el nebivolol, medicamento para tratar la hipertensión arterial, fueron seleccionados por ambas estrategias. Considerando que estas drogas son de fácil disponibilidad, el próximo paso será su evaluación in vitro como inhibidores de la TcNDPK1 y posteriormente como agentes tripanocidas.