BECAS
ARCUSCHIN Camila Daiana
congresos y reuniones científicas
Título:
Usando perfiles de actividad de enhancers y super-enhancers en múltiples líneas para explorar las perturbaciones transcripcionales en cáncer de mama
Autor/es:
CAMILA D. ARCUSCHIN; IGNACIO E. SCHOR; DENISE MUÑOZ
Lugar:
C.A.B.A.
Reunión:
Workshop; Biología Celular y Molecular del ARN 2018; 2018
Institución organizadora:
Fundación Instituto Leloir
Resumen:
La identidad y la función celular está determinada por redes regulatorias de la expresión génica, cuyo mal funcionamiento puede llevar a patologías como el cáncer. Los enhancers son elementos genéticos claves en éstas redes y la alteración de su función puede estar asociada a desregulación de vías oncogénicas y/o supresoras de tumores. A su vez, sabemos que existen regiones regulatorias de gran actividad, o super-enhancers (SE), con importante participación en los procesos tumorigénicos.El objetivo de este trabajo es utilizar los perfiles de actividad de enhancers a escala genómica en 18 líneas celulares para analizar los cambios transcripcionales que ocurren en diferentes tipos de cáncer de mama. Para ello se utilizaron datos de ChIP-seq para H3K27ac, marca típicamente presente en enhancers activos. A partir de éstos se obtuvieron los picos de señal en cada muestra, que luego fueron combinados en regiones regulatorias y clasificados en enhancers y SE. Luego se realizó un análisis de actividad diferencial agrupando las líneas de acuerdo a su subtipo celular. Esto permite obtener grupos de enhancers y/o SE específicamente activos en determinados tipos de tumores. La identificación de los motivos enriquecidos en estas regiones permitirá encontrar nuevas vías regulatorias sobre-activadas en grupos tumorales, abriendo la posibilidad a nuevas estrategias de intervención.
