DISEÑO RACIONAL DE INHIBIDORES DE LA ARN-POLIMERASA DEL VIRUS DE LA DIARREA VIRAL BOVINA

JUAN J. CASAL; DAMIÁN GONZÁLEZ VALDEZ; ELIANA CASTRO; LUCIA V CAVALLARO; EMILSE S LEAL; . MARIELA BOLLINI

san luis

Congreso; XXI Simposio Nacional de Química Orgánica Sociedad Argentina de Investigación en Química Orgánica; 2017

La proteína NS5B de BVDV es una enzima esencial para la replicación viral y seha determinado que posee actividad de ARN-polimerasa dependiente de ARN (RdRp).La estructura de la polimerasa de BVDV contiene un único dominio N-terminal, ademásde los dominios finger, palm y thumb que es común a otras polimerasas virales. Elobjetivo de este trabajo es identificar, sintetizar y ensayar moléculas pequeñas quebloqueen la función de la polimerasa y por ende la replicación viral.A través del software FPOCKET y DoGSiteScorer, se detectaron 4 bolsillos concaracterísticas "drogables" (Figura 1). Con los resultados obtenidos se procedió arealizar cribado virtual (VS) empleando diferentes librerías comerciales de compuestos,así como como una librería propia del laboratorio (300 compuestos) Mediante el empleode técnicas de acoplamiento molecular, se realizó un estudio de afinidad de lasestructuras con la proteína cristalizada (PDB 1S48 y 1S4F). Los complejos con mejorscoring e interacciones favorables fueron seleccionados y reagrupados en clustersconsiderando sus propiedades lipofílicas y diversidad estructural.Al realizar el VS partiendo de la librería ZINC, seseleccionaron una serie de estructuras con unión favorablea RdRp. Luego de la adquisición y/o síntesis de las mismas,se realizó el ensayo in vitro. De las moléculas ensayadas,un derivado del núcleo de quinazolina, presentó buenaactividad anti-BVDV y baja citotoxicidad (CE50: 9.33 μM,CC50: 51.6 μM). Mediante cálculos de dinámica molecular(MD) se estudió la estabilidad y energía del complejo entreel ligando y RdRp a través del tiempo. A partir de losresultados, se plantearon modificaciones estructurales adicho compuesto para mejorar la capacidad de unirse albolsillo. Actualmente, se están haciendo ensayos deactividad anti-BVDV de dichos derivados.Figura 1Se aplicó el mismo protocolo de VS partiendo de la librería Maybridge HitFinder.Los compuestos seleccionados fueron sintetizados y/o adquiridos a sus vendedores y,actualmente, se están haciendo ensayos de actividad anti-BVDV. A partir de estosresultados se podrá refinar el modelo y optimizar los hits encontrados.En conclusión, a partir de la combinación de las técnicas de VS y MD identificamosuna serie de compuestos estructuralmente diversos con actividad anti-BVDV. Lamodificación estructural de los hits permitirá mejorar el perfil farmacodinámico yfarmacocinético de los mismos, así como aportar nuevas ideas al desarrollo de antivirales.