IDENTIFICACIÓN DE GENES Y VÍAS METABÓLICAS RELACIONADOS CON EL SCORE DE CÉLULAS SOMÁTICAS EN VACAS LECHERAS

NANI JP; RASCHIA MA; CALVINHO LF; POLI MA; AMADIO AF

Montevideo

Congreso; XVI Congreso Latinoamericano de Genética; 2016

Asociación Latinoamericana de Genética

La mastitis bovina es una enfermedad frecuente de los rodeos lecheros y produce importantes pérdidas económicas. La identificación de animales resistentes es una alternativa al control de mastitis. Los estudios de asociación de genoma completo (GWAS) se centran en identificar marcadores genéticos asociados con una característica. Sin embargo, en caracteres poligénicos, cada marcador explica sólo una parte de la variabilidad genética. Nuestro objetivo fue identificar genes localizados en las regiones asociadas (p<0,05) con tres variables calculadas a partir del score de células somáticas por lactancia (la media aritmética AM, el valor máximo MAX y el promedio de los tres valores más altos TOP3) a partir de los resultados de un GWAS, realizado previamente con el fin de identificar vías metabólicas representadas que aporten información sobre los mecanismos involucrados en la resistencia a mastitis. Los datos consistieron en controles lecheros de 544 vacas Holstein y HolsteinxJersey de tambos de la provincia de Santa Fe, Argentina, y genotipos de 30.104 SNPs en cada animal. Utilizando bases de datos en MySQL se tomaron las regiones flanqueantes (± 20 kb) a cada SNP y se identificaron los genes en cada región. Se recuperaron 16.848 transcriptos y 12.191 genes con nombres oficiales de los cuales 2.773 están significativamente asociados con alguna de las características. Se identificaron 1.370, 1.025 y 1.265 genes asociados con AM, MAX y TOP3, respectivamente. Estas listas de genes permitieron evaluar cuáles son las vías metabólicas sobrerrepresentadas para cada característica.