SNPS EN REGIONES CANDIDATAS ASOCIADOS A CARACTERES PRODUCTIVOS EN BOVINOS HOLANDO Y CRUZAS HOLANDO X JERSEY

RASCHIA MA; MAIZON DO; NANI JP; AMADIO AF; POLI MA

Montevideo

Congreso; XVI Congreso Latinoamericano de Genética; 2016

Asociación Latinoamericana de Genética

Los análisis de asociación sobre regiones candidatas se basan en estudios previos que sugieren su influencia en el desarrollo de un fenotipo dado. El objetivo del trabajo fue identificar asociaciones entre SNPs en regiones candidatas y caracteres productivos en bovinos Holando y  HolandoxJersey a 305 días en su primera lactancia (producción de leche, PL; de grasa, PG; de proteína, PP; porcentaje de grasa, %G; de proteína, %P). Las PL, PG y PP se estimaron por el método de Fleischmann. Los %G y %P se infirieron a partir de las PG, PP y PL. El análisis de asociación se realizó con 10.182 SNPs para 804 (PL), 770 (PG y %G) y 769 (PP y %P) vacas de la cuenca lechera central argentina mediante las estrategias FASTA, GRAMMAS y EIGENSTRAT (GenABEL, R). Se utilizó el modelo Y= μ + β g g + β x x + e, donde Y representa al carácter, β g al efecto aditivo para cada SNP, g al vector de valores genotípicos, β x al efecto de covariables (raza, año de nacimiento, tambo, estación y año de inicio de lactancia y edad al primer parto), x al vector de covariables y e al término del error. La matriz de parentesco se estimó a partir de genotipos en 43.313 SNPs. Doce SNPs se asociaron a PL, 13 a PG, 8 a PP, 10 a %G y 13 a %P (5,10 -5 <p corr <1,10 -3 ), entre ellos, SNPs intragénicos en PIK3C2G, FBLN5 y DGAT1 (PL); DNAJC5B y PIK3C2G (PG); CDH6 y FBLN5 (PP); HIST1H2, EPHA6, ADIPOR2, RELN, PARVA y DGAT1 (%G) y ADIPOR2 (%P). Estos resultados coinciden con asociaciones reportadas previamente y también se reportan nuevas asociaciones que podrían explicar la variabilidad fenotípica observada.