Identificación de un nuevo elemento integrativo y conjugativo presente en el genoma de aislamientos clínicos de Shewanella spp

GISELA PARMECIANO DI NOTO; LAZZARO T; UONG S; MARÍA SOLEDAD RAMÍREZ; DANIELA CENTRÓN; CECILIA QUIROGA

Rosario

Congreso; XXIII Congreso Latinoamericano de Microbiología. XIV Congreso Argentino de Microbiología ALAM-CAM 2016.; 2016

Shewanella es un bacilo gram-negativo ampliamente diseminado en nichos acuáticos. La habilidad de Shewanella de prosperar en una gran gama de entornos muestra su plasticidad metabólica y genética. Últimamente, se dennotó que puede causar infecciones, por lo que se lo considera un patógeno oportunista emergente. La patogenicidad y la multirresistencia en las bacterias están relacionadas con la adquisición de elementos móviles. El ICESh95 es un elemento integrativo conjugativo (ICE), previamente caracterizado por nuestro grupo de investigación, hallado en la cepa clínica Shewanella sp. Sh95. El objetivo de nuestro estudio fue divisar la ocurrencia de ICE SXT-like en los aislamientos clínicos de Shewanella spp., caracterizar su región variable y su capacidad de transferirse. El ICESh95 pertenece a la familia de SXT/R391. Los miembros de esta familia se diseminan ampliamente en las gammaproteobacterias y poseen determinantes de virulencia, resistencia a los antibióticos y otros rasgos bacterianos, por lo tanto, decidimos analizar si estaba presente en otros aislamientos clínicos de Shewanella. Buscamos en 11 cepas de la colección del laboratorio mediante PCR utilizando cebadores específicos para detectar regiones conservadas, el oriT y el gen setR. Nuestros resultados mostraron que 3 de 11 muestras contenían un ICE SXT-like, las cepas Sh31, Sh82 y Sh392. Para determinar la diseminación, se evaluó el 16S rDNA y se realizó un árbol filogenético mediante el método maximum likelihood, el cual arrojó que las cepas Sh31 y Sh82 se agrupan en el mismo linaje de la cepa Sh95 con cepas ambientales, mientras que la cepa Sh392 se agrupa con el linaje S. haliotis/algae mayormente asociado a la clínica. Por otro lado, evaluamos la zona variable de los ICE donde pudimos observar que la cepa Sh31 posee el integrón de la región variable, HS3, del ICESh95. Ésta posee un gen cassette de resistencia a trimetoprima, dfrA15, un gen cassette de resistencia a amonios cuaternarios, qacH, un intrón de grupo II clase C-attC llamado Sh.sp.I4, intI9, y una IS4, mientras que las cepas Sh82 y Sh392 no lo poseen. Además, se evaluó el sitio de inserción de los ICE de las cepas positivas ya que el ICESh95 resultó invadir un sitio novel. Nuestros resultados arrojaron que en los tres casos, estos ICEs se insertaron en el mismo sitio, upstream del gen pabA. Por último, el ICE de Shewanella sp. Sh82 fue él único capaz de escindirse y circularizarse y mediante ensayos de conjugación demostró ser capaz de transferirse a otro organismo con una alta eficiencia. Como conclusión, podemos decir que nuestros resultados reflejaron una alta tasa de ocurrencia de los ICE SXT-like en el género Shewanella, además éstos poseen genes de resistencia antibiótica y determinantes virulentos. Se encuentran diseminados tanto en aislamientos clínicos como ambientales, lo que se convierte en una potencial amenaza cuando las bacterias ambientales como Shewanella actúan como su vector de propagación.