PERSONAL DE APOYO
LITWIÑIUK Sergio Leandro
congresos y reuniones científicas
Título:
DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO EN EL GENOMA BOVINO: QUÉ CONSEGUIMOS VER CON 50.000 SNPS?
Autor/es:
LITWIÑIUK , SERGIO; CARIGNANO , HUGO; POLI , MARIO; MIRETTI , MARCOS
Reunión:
Jornada; IX Jornadas Científico-Tecnológicas de la Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales - UNaM; 2015
Resumen:
El uso de marcadores genéticos ha posibilitado detectar regiones del genoma asociadas a la expresión fenotípica de loci para caracteres cuantitativos (QTL). Las tecnologías de genotipificación actuales hacen posible la detección simultánea de >700.000 SNPs por individuo. El estudio del desequilibrio de ligamiento (LD) permite detectar la incidencia de la recombinación y describir la genealogía de los bloques de segregación en porciones del genoma que contienen genes de importancia económica. La estimación del LD es una importante herramienta considerada en los programas de ?Selección Genómica?. El objetivo de este trabajo fue evaluar los alcances de las estimaciones de LD a partir de datos de genotipificación de mediana resolución (>50.000 SNPs)en bovinos. El LD medio y decaimiento del LD en función de la distancia física a lo largo de los cromosomas y en regiones específicas fueron estimados y graficados. También se estimaron valores de cobertura ?área total bajo LD?y longitud media de los bloques de haplotipos. Finalmente regiones genómicas con baja densidad de marcadores fueron analizadas en detalle a fin de encontrar indicios de la naturaleza de tales deficiencias en las densidades de SNPs. En este estudio se ha caracterizado el desequilibrio de ligamiento y la estructura haplotípica de una población comercial de bovinos lecheros (Bos taurus) con datos de genotipificación generados para >900 individuos. Los resultados obtenidos son relavantes para el análisis de LD en forma global en el genoma. No obstante, el área de cobertura es proporcionalmente muy baja al igual que el LD útil comparado con estudios previos. El LD contribuye a determinar más efectivamente el mapeo genético y físico, y para la predicción más eficiente de características asociadas al aumento en la producción y resistencia a enfermedades