ANALISIS BIOINFORMÁTICO DE GENOMAS DE INSECTOS Y LA EVOLUCIÓN DE LOS ELEMENTOS REGULATORIOS.

BARBERO ANGELA; RIVA NATALI; GORGA AGOSTINA; MOLINA CELESTE

San Carlos de Bariloche

Congreso; XLIII CONGRESO ARGENTINO DE GENÉTICA IV REUNIÓN REGIONAL SAG-LA PAMPA PATAGONIA; 2014

Sociedad Argentina de genetica

Uno de los grandes desafíos en la interpretación de los genomas es entender la codificación temporal y espacial de la información de la expresión génica. Uno de los primeros pasos para estudiar estos procesos es identificar regiones regulatorias. En eucariotas, esta información se organiza de forma modular en enhancers, donde se encuentran agrupados los sitios de reconocimiento de múltiples factores de transcripción. El organismo mejor conocido con demostración experimental de los enhancers es D. Melanogaster. A partir de la información genómica disponible de cuatro especies de insectos, D. melanogaster, Tribolium castaneum, Oncopeltus fasciatus y Rhodnius prolixus, se definieron como modelos genes involucrados en la segmentación embrionaria de los que se posee información experimental a partir de estudios en D. melanogaster (Krüppel, giant, hunchbach, knirps, tailless, engrailed y even skipped). Los genes fueron identificados por BLAST en los genomas disponibles y en las secuencias upstream al origen de transcripción fueron definidas las potenciales regiones regulatorias. El análisis se llevó a cabo usando el Software PATSER para la búsqueda de los sitios de unión para factores de transcripción y el software STUBB para el análisis de clustering. Esto permitió identificar potenciales regiones regulatorias para cada uno de los genes, observando que en algunos casos estos dominios se encuentran conservados tanto en la posición relativa al inicio de la transcripción como en el entramado de sitios de unión para factores de transcripción en las diferentes especies analizadas.