Identificación y caracterización molecular de Strawberry crinkle virus de frutilla en Argentina

CECILIA LUCIANI; MARCOS GIOVANI CELLI; MARIA CECILIA PEROTTO; ADA KARINA TORRICO; FLORENCIA ASINARI; VILMA CECILIA CONCI

San Miguel de Tucumán

Congreso; 3º Congreso Argentino de Fitopatología; 2014

AAF - Asociación Argentina de Fitopatólogos

Strawberry Crinkle Virus (SCV) es responsable de una importante reducción en el rendimiento y en la calidad de la fruta. La presencia de SCV fue detectado en Argentina desde 2010 en plantas de frutilla provenientes de Lules, Tucumán mediante RT-PCR anidado con cebadores específicos que amplificaron un fragmento de 573pb. La secuencia de dicho fragmento reveló 84,1% de identidad con secuencias publicadas en el GenBank. En este trabajo fue utilizado el par de cebadores mencionado y se diseñaron dos pares nuevos que amplifican fragmentos de 744nt y 687nt respectivamente. Con los tres juegos de cebadores mencionados se logró amplificar fragmentos de los tamaños esperados, que fueron clonados y secuenciados. El ensamblado de los tres fragmentos genómicos permitió obtener una secuencia consenso de 1897nt. El porcentaje de identidad con secuencias publicadas en el GenBank varió entre 95,2% con un aislamiento de SCV de Alemania (AY250986.2 - cobertura 100%) y 88,9% con un aislamiento proveniente de los Países Bajos (AY331388 - cobertura 83%). Los resultados confirman la presencia del virus en las plantas de frutilla de Argentina con altos porcentajes de identidad con otros aislamientos publicados.