• Predicción de estructuras de cristales con moléculas flexibes en su celda

FERRARO, M, FACELLI, J., BAZTERRA V

SALTA

Congreso; 92 REUNION NACIONAL DE FISICA; 2007

En este trabajo describimos un nuevo método de cálculo distribuido en clusters de computadoras de última generación, destinado a predecir las estructuras de cristales que muestran en su celda moléculas “flexibles”. Esta denominación llamativa para un cristal obedece a que las moléculas de la celda muestran algunos grupos sustituyentes que pueden adoptar diferentes conformaciones según cuál sea el ángulo  diedro que forma con el resto de la molécula. La búsqueda de las mejores estructuras se realiza empleando algoritmos genéticos: esto es suponer muchos individuos en una población, tal que cada individuo está codificado por medio de un conjunto de parámetros, variables (genes) a determinar, que son, por ejemplo, los parámetros cristalográficos, las orientaciones de cada molécula en la celda, los diedros presentes en cada molécula. El método recorre los 230 grupos cristalográficos para efectuar la búsqueda, empleando algunas restricciones para evitar estructuras no físicas, y toma como función de aptitud la energía. Se emplean seudopotenciales para describir las interacciones y el método CHARMM para optimizar los individuos (cristales). El proceso está completamente paralelizado y en esta comunicación se muestran algunos de los resultados obtenidos recientemente en nuestra participación en el blind test CSP207