Análisis de QTL mediante modelos mixtos con efectos aleatorios de interacción genotipo ambiente

ARROYO, A.; BALZARINI, M.

San Miguel de Tucumán

Congreso; XXXV Congreso Argentino de Genética; 2006

Sociedad Argentina de Genética

El análisis de QTL se basa en encontrar regiones del genoma ligadas a la expresión fenotípica de un carácter cuantitativo. Frecuentemente la evaluación de los materiales se realiza en más de un ambiente debido a la omnipresencia de la interacción genotipo ambiente (GEI). La GEI se refiere a la respuesta diferencial de los genotipos a través de un rango de ambientes y debería incorporarse a la hora de detectar asociaciones entre marcadores y QTL. El análisis de QTL puede ser realizado mediante un modelo lineal de ANOVA involucrando los efectos de poligenes, los efectos ambientales y su interacción además de los efectos de marcadores que explican la variación del fenotipo como consecuencia de QTLs asociados a esos marcadores. Un modelo alternativo es aquel que considera los efectos de ambiente y los de marcadores como fijos y los efectos poligénicos y su interacción con el ambiente como aleatorios. Este trabajo ilustra el análisis de QTL para este modelo  bajo  estructuras alternativas de covarianzas entre los términos de GEI. Se comparan resultados con procedimientos usuales (marcador por marcador y mapeo por intervalo). La estimación bajo estos modelos mixtos no sólo mejora la estructura de variabilidad residual sino que también aporta información sobre estabilidad y hace posible el análisis aún cuando no todos los genotipos se evalúan en cada ambiente.