INVESTIGADORES
ALVAREZ Roberto
congresos y reuniones científicas
Título:
Uso de tecnologías de secuenciación de ADN de alto rendimiento para el estudio de comunidades microbianas del suelo
Autor/es:
N. RASCOVAN, M.B. CARBONETTO, M.D. REINERT, S. REVALE, R. ALVAREZ, A. MENTABERRY, M.P. VAZQUEZ
Reunión:
Congreso; XXIII Congreso Argentino de la Ciencia del Suelo; 2012
Resumen:
La biodiversidad de
microorganismos es esencial para la calidad y nutrición del suelo, pero más del
90% de las bacterias y hongos del suelo son aún desconocidos. La llegada de las
tecnologías de secuenciación de ADN de alto rendimiento ha permitido acelerar
drásticamente el estudio de la biología del suelo permitiendo analizar en forma
directa y sin necesidad de cultivos y aislamientos, las comunidades de
microorganismos a partir de sus secuencias de ADN. Desde el 2010 esta
tecnología se encuentra disponible en Argentina en el instituto INDEAR de
Rosario. Entre los objetivos principales de su incorporación se encuentra la
caracterización de las comunidades microbianas de los suelos argentinos y el
estudio del impacto de la agricultura sobre estas comunidades. Hasta el momento
se han realizado 18 corridas completas de muestras de suelo obtenidas en cinco
puntos de la región pampeana generando más de 17 millones de secuencias de ADN
metagenómico y 1 millón de secuencias de 16S rRNA, un set de datos denominado
PAMPA Dataset. El análisis de los datos permitió identificar más de 7.000
especies microbianas a partir de las secuencias genómicas y estimar 32.000
posibles especies a partir de los marcadores 16S rRNA. Además se pudieron
analizar 466 categorías metabólicas e identificar 14.675 funciones enzimáticas.
La incorporación de este tipo de tecnologías en el estudio de la biología de
suelos en la región podría representar de esta manera un avance sustancial en
el conocimiento de las comunidades microbianas del suelo y su rol en el
ecosistema.