Más allá del tamaño de los fragmentos: microsatélites basados en secuencias para estudios genético-poblacionales de una especie forestal neotropical

GONCALVES, A.L.; GARCÍA M.V.; HEUERTZ, M

Río Cuarto, Córdoba

Congreso; LI Congreso Argentino de Genética; 2023

Sociedad Argentina de Genética

Los clásicos marcadores microsatélites (SSR) permiten analizar la acción de procesos microevolutivos y eventos demográficos que definen los patrones de variación genética poblacional a través del tiempo y del espacio. El polimorfismo detectado deriva de la variabilidad en la longitud de los loci SSR. Los amplicones del mismo tamaño para un locus pueden llevar a una subestimación de la diversidad genética poblacional debido a homoplasia. Esto puede ser salvado mediante marcadores microsatélites basados en secuencias (SSRseq) obtenidos por medio de secuenciación de nueva generación y baja cobertura. El reciente desarrollode estos marcadores para Anadenanthera colubrina var. cebil (Leguminosae) permitió caracterizar la homoplasia en 33 loci mediante la codificación de los alelos por tamaño y por secuencia. Se caracterizó la diversidad genética y se contrastaron los resultados obtenidos considerando ambos conjuntos de datos. La homoplasia de tamaño detectada alcanzó una media de 40,27% para todos los loci. Se detectó un número significativamente mayor de alelos por locus y una elevada heterocigosis considerando polimorfismos de secuencia en comparación con el análisis basadoen el tamaño de los amplicones. Así, el desarrollo de los SSRseq específicos de A. colubrina var. cebil aumenta la resolución de la genotipificación de los individuos de esta especie, potenciando el desarrollo de estudios genético-poblacionales con miras a la conservación y manejo sustentable de esta especie forestal neotropical.