Rice necrosis mosaic virus: new virus in rice crops in Argentina

SOLIS, VALENTINA EVA; MARÍA FLORENCIA BRUGO CARIVALI; CECILIA ELIZABETH LUCIANI; MARIA CECILIA PEROTTO; MARTINE BANGRATZ; FILLOUX, DENIS; POULICARD, NILS; HEBRARD, E.; ROUMAGNAC, PHILIPPE; MARCOS GIOVANI CELLI

Brasilia

Congreso; 53º Congresso Brasileiro de Fitopatología; 2023

Sociedade Brasileira de Fitopatologia (SBF)

Rice necrosis mosaic virus (RNMV) es un miembro del género Bymovirus en la familia Potyviridae, con genoma bipartito, lineal y de sentido positivo. Es transmitido por el protista Polymyxa graminis y fue reportado en Japón y India por causar síntomas de mosaico caracterizados por manchas amarillas y rayas foliares. Causa lesiones necróticas en las porciones basales de tallos y vainas. Las plantas infectadas también pueden presentarse moderadamente atrofiadas y con mala formación. En 2017 se recolectaron plantas de arroz en la región de Yahapé (Corrientes) que presentaban mosaico foliar, necrosis y deformaciones. Las plantas fueron negativas para el virus del entorchamiento del arroz (Rice stripe necrosis virus). Con el objetivo de detectar el agente causal de los síntomas observados, una muestra fue enviada para la secuenciación masiva utilizando metodología de VANA-NGS Illumina (Virion-Associated Nucleic Acids - Next-Generation Sequencing). Los contigs resultantes fueron comparados por Blastn con la base de datos del GenBank y revelaron la presencia de un contig de 1388 nt con 82% de identidad con un aislamiento de RNMV de Japón (LC055681). El contig correspondió a un fragmento en la región codificante de la poliproteína del RNA1 (NIb y CP). Para confirmar la detección del RNMV en plantas de arroz utilizando RT-PCR como un segundo método, se emplearon cebadores específicos que amplifican un fragmento genómico de la región de la NIb y CP. Por ese método se pudo amplificar el fragmento de tamaño esperado de 613nt, lo que confirmó la infección de plantas de arroz por el RNMV. Este es el primer reporte de RNMV en Argentina y América.