Secuencias saltarinas del genoma de mamíferos, detección de un elemento transponible en el intrón 7 del beta fibrinógeno de Eligmodontia (Rodentia, Cricetidae, Sigmodontinae).

SANTANDER M.D.; FERRO, J.M.; BUSCHIAZZO, L.M; OJEDA A.; J. P. JAYAT; NOVILLO A; TETA P; C. LANZONE

San Salvador de Jujuy

Jornada; XXXIV Jornadas Argentinas de Mastozoología; 2023

SAREM

Los elementostransponibles (TEs) son secuencias de ADN eucariota que se movilizan dentro delos genomas y generalmente dejan marcas características en las regionesafectadas. Los roedores presentan una gran diversidad de TEs principalmente porla acumulación de diferentes familias de LTRs, llamados así por sus largassecuencias repetidas terminales en ambos extremos y con el mismo sentido(repeticiones directas). Aquí amplificamos y secuenciamos el intrón 7 del betafibrinógeno (FGB) con los primers BFIB17_mammL y BFIB17_mammU en Eligmodontiapuerulus, E. moreni, E. typus y E. morgani. Estas secuencias se compararon conlas disponibles para filotinos y akodontinos y varias especies de Sigmodon (Sigmodontini).El análisis reveló una secuencia adicional en de ~350pb, enmarcada en unaduplicación directa de 8pb. La búsqueda en bases de datos de TEs mostró que lainserción tiene homología putativa con retrotransposones de clase I(SigHis-1.158), del orden de los LTRs, de la superfamilia de los ERVK(LTR-ERVK) descritos en S. hispidus. A partir del genoma de esta especie y sus anotaciones,se recuperaron estas copias, se alinearon y generaron nuevas secuenciasconsenso refinadas. Ninguna se encontró asociada al FGB en Sigmodon. Una de lasvariantes, de ~3Kb y 108 copias completas, está flanqueada a ambos lados porlargas repeticiones terminales directas (~350pb) y correspondería al retrotransposóncompleto, presentando un marco abierto de lectura con homología a una proteínacon dominios proteasa y polimerasa. Otra variante presentó una longitud similara la inserción de Eligmodontia, con ca. 682 copias, correspondiendo a lasrepeticiones terminales de la variante mayor en la forma de sólo -LTR. Comoresultado de su inserción, ambos TEs generan duplicaciones directas (6-8pb) enambos extremos, correspondiéndose con la duplicación observada en Eligmodontia.Trabajos previos describieron inserciones de TEs en los intrones 4 y 7 del FGBen diversos grupos de mamíferos. La inserción del intrón 7 es consideradaancestral en estos animales y se habría perdido en Rodentia. Aquí reportamos lainserción de un nuevo TE en este intrón de Eligmodontia, apoyando la hipótesisde que esta región genómica es un punto caliente para nuevas inserciones.