Perfil diferencial de miARN derivados de vesículas extracelulares en pacientes con HCV y HCV/HIV con diferentes estadios de fibrosis hepática.

CAIROLI VICTORIA; VALLE-MILLARES, D; AMEIGEIRAS, BEATRIZ; DE MATTEO E; FERNÁNDEZ RODRÍGUEZ, A; PRECIADO, MV; VALVA P

Congreso; XLII REUNIÓN CIENTÍFICA ANUAL DE LA SOCIEDAD ARGENTINA DE VIROLOGÍA; 2022

En la hepatitis C crónica (CHC) la coinfección con el virus de la inmunodeficiencia humana (HIV) impacta negativamente en la progresión del daño hepático. Recientemente, las vesículas extracelulares (VE) han adquirido relevancia en la patogenia de diversas hepatopatías como comunicadores intercelulares y mediadores de procesos patológicos. Se ha descripto que el virus de hepatitis C (HCV) y HIV modifican el contenido de microARN de las VE, pero poco se sabe sobre su impacto en la patogenia o su posible rol como biomarcadores de daño hepático. El objetivo fue caracterizar el contenido de miARN de VE en pacientes HCV+ y HCV+/HIV+, y analizarlo en forma comparativa con respecto a la severidad de la fibrosis hepática para evaluar su impacto en la patogenia. A partir de plasma de 50 individuos con CHC [36% fibrosis significativa (F≥2)] [21 HCV+ (52,4% F≥2) y 29 HCV+/HIV+ (22,6% F≥2)] se aislaron las VE, se extrajo el ARN y se secuenciaron los miARN por NGS. Luego se realizó la identificación de miARN con miRDeep2, la evaluación de la expresión diferencial significativa (SDE) entre grupos por edgeR y el análisis de predicción de genes target/rutas moleculares asociadas con DIANAmirPath. Finalmente, se estudió el valor diagnóstico de los miARN con SDE mediante el análisis de las curvas ROC. El análisis de expresión diferencial de los miARN de las VE de los pacientes con CHC demostró 2 miARN con SDE upregulados en el grupo con F≥2 (miR-122-5p log2FC=1,67, FDR=9,3E-5, miR-194-5p log2FC=0,62, FDR=0,003) que, in silico, mostraron regular genes implicados en la producción de matriz extracelular y en vías oncogénicas mediadas por proteoglicanos. Por su parte, el subgrupo HCV+ presentó 2 miARN con SDE upregulados en el grupo con F≥2 (miR-3615 log2FC=0.94 FDR=0.009, miR-320a-3p log2FC=0.59 FDR=0.048), los cuales regulan las rutas de señalización de TGF-β y de la protein kinasa-hpo. El subgrupo HCV+/HIV+ mostró 8 miARN up- (miR-122-5p, miR-107, miR-451a, miR-194-5p, miR-22-5p, miR-1246, miR-15b-5p, miR-4508, log2FC>0.7 FDR≤0.04) y 7 downregulados (miR-423-3p, miR-128-3p, miR-328-3p, miR-125a-5p, miR-10a-5p, miR-10b-5p, miR-7d-3p, log2FC≤0.6 FDR