“PREDICCION DE ESTRUCTURAS CRISTALINAS DE INTERES FARMACOLOGICO MENDIANTE EL USO DE ALGORITMOS GENETICOS Y LOS RECURSOS COMPUTACIONALES DE LA OPEN SCIENCE GRID (OSG)”

VARELA, KRISTAL N.; PAGOLA, GABRIEL I.; FERRARO, MARTA B.; LUND, ALBERT M.; ORENDT, ANITA M.; FACELLI, JULIO C.

Santa Fe

Congreso; XVI Reunión Anual de la Asociación Argentina de Cristalografía; 2021

UNL- Facultad de Bioquimica y CIencias Biologicas

Desde hace casi dos décadas nuestro grupo trabaja en la predicción de estructuras cristalinasmoleculares de interés farmacológico mediante el desarrollo de un código propio basado en algoritmosgenéticos, denominado Modified Genetic Algorithms for Crystal (MGAC). Actualmente estamosdesarrollando una nueva versión del código, donde las optimizaciones locales de las estructurascandidatas se realizan a nivel de Density Functional Therory (DFT) empleando el software QuantumEspresso (QE) [1]. Dado que estos cálculos insumen mucho tiempo de computo, estos se realizan demanera asincrónica empleando recursos provistos por la Open Science Grid (OSG) [2]. El programaprincipal del MGAC corre en un servidor que se encarga de ir enviando las optimizaciones a efectuara la OSG y de mantener una lista actualizada de los cristales candidatos con menores energías (mejorescandidatos). Al finalizar cada optimización se envía la salida de QE al servidor donde corre el códigomaestro (MGAC) que se encarga de procesar la información y evaluar si corresponde descartar elcandidato optimizado o incorporarlo a la lista de mejores cristales. Por otra parte, el MGAC se encargade construir periódicamente una segunda lista con un conjunto de cristales hijos, generados a partir dela recombinación de elementos de la lista de mejores cristales (padres). Los cristales de la segundalista son candidatos disponibles, listo para ser distribuidos en forma asincrónica a medida que lopermitan los recursos disponibles de la OSG. En este trabajo se analizan las características de estanueva implementación y se presenta un conjunto de resultados preliminares empleando como sistemamolecular de testeo el metanol. Se ha elegido este este sistema por ser un sistema pequeño y de interésen la bibliografía [3].Palabras clave: Algoritmos Genéticos, Cristales Moleculares, Computación Grid.[1] www.quatum-espresso.org[2] www.opensciencegrid.osg[3] Phy.Chem.Chem.Phys., 2016, 18, 2736