Estimadores de la consanguinidad genómica mediante diferentes métodos en una población de cerdos

ANGARITA, BELCY K.; SAAVEDRA, ROBERTO; HUIYU WANG; KNAPP, P.W. ; FORNERIS, N. S.; CANTET, RODOLFO J.C.

Congreso; Congreso de la Asociación Argentina de Producción Animal; 2021

Asociación Argentina de Producción Animal

El coeficiente de consanguinidad (F) es uno de los parámetros de interés en mejoramiento animal. Conceptualmente, el F de un individuo es igual a la probabilidad que, en cualquier punto en el genoma, lleve dos genes idénticos por descendencia (IBD), es decir con el mismo origen ancestral. En la práctica, F fue estimado empleando información del pedigree. Sin embargo, con la disponibilidad de datos de marcadores genómicos (Polimorfismo de un solo nucleótido, SNP), se han desarrollado estimadores a partir de paneles densos de SNP (Purcell et al.,2007), o mediante la detección de segmentos homocigotas por descendencia (HBD) (Druet et al., 2017). Estos dos métodos fueron comparados solo en poblaciones reales bovinas de tamaño pequeño. El objetivo del presente trabajo consiste en comparar la distribución de los estimadores de F por pedigree, por un método puntual y por segmentos IBD en una población comercial de cerdos.