Identificación in sílico de nuevas regiones genómicas asociadas al carácter tipo de carpelo en frutos de tomate (S. lycopersicum)

VAZQUEZ, DANA V.; CAMBIASO, VLADIMIR; PEREIRA DA COSTA, JAVIER H.; RODRÍGUEZ, GUSTAVO R.

Mendoza

Congreso; XVII Congreso Latinoamericano de Genética, XLVII Congreso Argentino de Genética, LII Reunión Anual de la Sociedad de Genética de Chile, VI Congreso de la Sociedad Uruguaya de Genética, V Congreso Latinoamericano de Genética Humana y V Simposio Latinoameri; 2019

Sociedad Argentina de Genética

Existe una gran diversidad para la forma de fruto en el tomate cultivado y es un carácter de gran importancia económica. Nuevas versiones del genoma de referencia en tomate y metodologías de análisis in sílico, proveen herramientas para reanalizar la información existente y obtener resultados inéditos. A partir de un cruzamiento intravarietal, se realizó un análisis de grupos discrepantes y secuenciación de genoma completo, para detectar regiones genómicas asociadas al carácter tipo de carpelo (TC, fusionado o no fusionado). Se identificó una región en la base del cromosoma 6 asociada al carácter. Un análisis posterior de TC en la generación F2 y las retrocruzas de la F1 hacia ambos parentales mostró que las frecuencias observadas se ajustan a la segregación esperada para una epistasis doble recesiva. El objetivo fue identificar regiones genómicas asociadas a la segregación de TC mediante nuevas aproximaciones metodológicas bioinformáticas para explicar su herencia. Las secuencias genómicas de los grupos discrepantes se alinearon a la versión SL3.0 del genoma de referencia de tomate y se compararon. Se identificaron los polimorfismos genómicos asociados al carácter mediante la metodología G´ utilizando el paquete QTLseqr de R. Se logró identificar un nuevo QTL putativo de 59Mb de longitud en la región centromética del cromosoma 10 (p