En busca de alginato-liasas: análisis comparativo de metagenomas de cuatro ambientes costeros

MATOS, MARINA; ANSELMINO, LUCIANO; LOZADA, MARIANA; HENRISSAT, BERNARD; DIONISI, HEBE M.

Puerto Madryn

Jornada; Jornada de Becarios CENPAT; 2015

Espacio Becarios, CENPAT

p { margin-bottom: 0.25cm; direction: ltr; color: rgb(0, 0, 0); line-height: 120%; orphans: 2; widows: 2; }p.western { font-family: "Times New Roman",serif; font-size: 12pt; }p.cjk { font-family: "Times New Roman",serif; font-size: 12pt; }p.ctl { font-family: "Times New Roman",serif; font-size: 12pt; }a:link { color: rgb(0, 0, 255); }Undaria pinnatifidaes un alga parda invasora presente en gran parte de nuestra costaatlántica. Diversos esfuerzos están enfocados en la extracción yel uso redituable de la misma. Hasta un 40% del peso seco de lasalgas pardas puede estar constituido por alginatos, polímetroslineales de los monosacáridos β-D-manuronatoy/o α-L-guluronato.Estos, mediante el metabolismo adecuado, pueden utilizarse para laproducción de bioetanol y otros compuestos. Debido a la abundanciade las algas pardas en ambientes fríos, éstos representan fuentesprometedoras de enzimas alginato-liasas. Estas enzimas catalizan laruptura de las uniones glicosídicas del polímero. Estudiamos ladistribución biogeográfica de genes potencialmente codificantespara alginato-liasas, en 23 metagenomas de sedimentos submareales de4 ambientes marinos fríos: Archipiélago Svalbard (Noruega, NOR),Mar Báltico (Suecia, SWE), Bahía Ushuaia (Argentina, ARG) y CaletaPotter (Península Antarctica, ANT). Se realizó la búsqueda dehomólogos de alginato-liasas en los metagenomas ensamblados, pornombre y utilizando el algoritmo blast con 23 secuencias dereferencia. Identificamos 2705 fragmentos génicos relacionados conalginato-liasas, la mayor parte en las regiones ANT (42%) y NOR(33%), y de los cuales, 359 secuencias corresponden posiblemente agenes enteros. Utilizando el algoritmo blast, se compararon las 2705secuencias con todas las polisacárido-liasas presentes en la base dedatos CAZy en febrero de 2014 (3977 secuencias). La mayor parte delas secuencias mostraron homología con alginato-liasas de lasfamilias PL17 (30.5%), PL7 (28.3%) o PL6 (22.2%). Las muestras de SWEposeían mayor proporción de secuencias novedosas (28% presentabanvalores de E ≥10-10en el blast), mientras que las secuencias de NOR, ANT y ARG eranmenos divergentes respecto a las previamente descritas (12%, 5% y 4%poseían valores de E≥10-10,respectivamente). Este estudio revela el alto potencial para degradaralginatos que presentan las comunidades microbianas de los sedimentosde los ambientes estudiados.