METAGENÓMICA DE SEDIMENTOS COSTEROS CONTAMINADOS CON HIDROCARBUROS EN AMBIENTES POLARES Y SUBPOLARES DE AMBOS HEMISFERIOS

ESPÍNOLA, FERNANDO; DIONISI, HEBE M.; LOZADA, MARIANA

Puerto Madry

Jornada; Jornada de Becarios CENPAT; 2015

Espacio Becarios, CENPAT

p { margin-bottom: 0.25cm; direction: ltr; color: rgb(0, 0, 0); line-height: 120%; }p.western { font-family: "Liberation Serif","Times New Roman",serif; font-size: 12pt; }p.cjk { font-family: "Droid Sans"; font-size: 12pt; }p.ctl { font-family: "FreeSans"; font-size: 12pt; }a:link { }A pesar de la gran importancia delas comunidades microbianas para el funcionamiento de los ciclosbiogeoquímicos y la provisión de servicios ecosistémicos, su grancomplejidad y su baja proporción de miembros cultivables (menos del1%) hacen que su estructura y función permanezcan aún pococomprendidas. Losmétodos independientes del cultivo, y en especial la metagenómica,permiten estudiar los microorganismos ambientales obteniendoinformación a nivel de la comunidad. Elobjetivo de este trabajo fue estudiar la estructura y potencialmetabólico de las comunidades microbianas de sedimentos costeroscrónicamente contaminados con hidrocarburos en ambientes polares ysubpolares. Se analizaron 23 muestras en cuatro regiones de amboshemisferios (Archipiélago Svalbard, Noruega; Mar Báltico, Suecia;Bahía Ushuaia, Argentina y Caleta Potter, Antártida). La estructurade la comunidad se analizó mediante la secuenciación en gran escaladel gen biomarcador filogenético ARN ribosomal 16S, obteniendose untotal de más de 105secuencias por muestra (cobertura=99,06±0,25%),las cuales fueron analizadas en la plataforma QIIME. Los metagenomasfueron secuenciados al azar usando la plataforma Illumina HiSeq 2000,generando un total de 2,86±0.98E+08lecturaspor muestra, los cuales fueron ensamblados, anotados, y analizados enla plataforma IMG/M (http://img.jgi.doe.gov/m/).Se realizaron análisismultivariados comparativos con el paquete vegan(www.r-project.org/vegan).Se encontró una enorme diversidad de microorganismos en estossedimentos, especialmente en el mar Báltico (índice deShannon=8,73±0,04).La estructura filogenética y funcional de las comunidades resultódiferente entre los sitios, observándose una correlaciónsignificativa con variables ambientales clave como la salinidad, latemperatura y la contaminación por hidrocarburos analizada porGC-MS. Se observó una correlación significativa entre los nivelesde hidrocarburos y la abundancia de deltaproteobacterias sulfatoreductoras llegando a abundancias de más del 10% en las muestras máscontaminadas, lo cual sugiere una relevancia de procesos anaeróbicosde biodegradación en estos ambientes. p { margin-bottom: 0.25cm; direction: ltr; color: rgb(0, 0, 0); line-height: 120%; }p.western { font-family: "Liberation Serif","Times New Roman",serif; font-size: 12pt; }p.cjk { font-family: "Droid Sans"; font-size: 12pt; }p.ctl { font-family: "FreeSans"; font-size: 12pt; }a:link { }A pesar de la gran importancia delas comunidades microbianas para el funcionamiento de los ciclosbiogeoquímicos y la provisión de servicios ecosistémicos, su grancomplejidad y su baja proporción de miembros cultivables (menos del1%) hacen que su estructura y función permanezcan aún pococomprendidas. Losmétodos independientes del cultivo, y en especial la metagenómica,permiten estudiar los microorganismos ambientales obteniendoinformación a nivel de la comunidad. Elobjetivo de este trabajo fue estudiar la estructura y potencialmetabólico de las comunidades microbianas de sedimentos costeroscrónicamente contaminados con hidrocarburos en ambientes polares ysubpolares. Se analizaron 23 muestras en cuatro regiones de amboshemisferios (Archipiélago Svalbard, Noruega; Mar Báltico, Suecia;Bahía Ushuaia, Argentina y Caleta Potter, Antártida). La estructurade la comunidad se analizó mediante la secuenciación en gran escaladel gen biomarcador filogenético ARN ribosomal 16S, obteniendose untotal de más de 105secuencias por muestra (cobertura=99,06±0,25%),las cuales fueron analizadas en la plataforma QIIME. Los metagenomasfueron secuenciados al azar usando la plataforma Illumina HiSeq 2000,generando un total de 2,86±0.98E+08lecturaspor muestra, los cuales fueron ensamblados, anotados, y analizados enla plataforma IMG/M (http://img.jgi.doe.gov/m/).Se realizaron análisismultivariados comparativos con el paquete vegan(www.r-project.org/vegan).Se encontró una enorme diversidad de microorganismos en estossedimentos, especialmente en el mar Báltico (índice deShannon=8,73±0,04).La estructura filogenética y funcional de las comunidades resultódiferente entre los sitios, observándose una correlaciónsignificativa con variables ambientales clave como la salinidad, latemperatura y la contaminación por hidrocarburos analizada porGC-MS. Se observó una correlación significativa entre los nivelesde hidrocarburos y la abundancia de deltaproteobacterias sulfatoreductoras llegando a abundancias de más del 10% en las muestras máscontaminadas, lo cual sugiere una relevancia de procesos anaeróbicosde biodegradación en estos ambientes.