Respuesta a la exposición a hidrocarburos de comunidades bacterianas de sedimentos costeros de la patagonia evidenciada por biomarcadores filogenéticos y funcionales

LOZADA, MARIANA; MARCOS, MAGALÍ; COMMENDATORE, MARTA; DIONISI, HEBE

Ciudad Autónoma de Buenos Aires

Congreso; XIII Congreso Argentino de Microbiología - 2013; 2013

Asociacion Argentina de Microbiología

Distintas actividades antrópicas generan riesgos de contaminación por hidrocarburos en la costa Patagónica. Los sedimentos tienden a acumular estos compuestos, y sus comunidades microbianas son un factor clave para la capacidad de recuperación del ambiente. El objetivo de este trabajo fue evaluar, en sistemas experimentales, la respuesta de la comunidad bacteriana de los sedimentos ante la exposición a hidrocarburos. Se seleccionaron 3 sitios con distinta historia de contaminación: Playa Fracasso, Península Valdés, Chubut, no impactada por hidrocarburos de origen antropogénico (PF); Caleta Córdova, Chubut, crónicamente contaminada por hidrocarburos y afectada por derrames de petróleo crudo (CC), y Planta Orión, Bahía Ushuaia, Tierra del Fuego, sitio crónicamente contaminado con combustibles (OR). Se construyeron sistemas experimentales constituidos por 1 parte de sedimento intermareal y 2 partes de agua de mar filtrada. Los distintos tratamientos consistieron en: 0,4 % (v/v) de petróleo crudo, 0,2% (p/v) de fenantreno ó pireno, y un control sin agregado de hidrocarburos. Luego de 20 días de incubación a 15ºC, se extrajo ADN metagenómico (FastDNA Spin Kit for Soil, MP Biomedicals). La estructura de la comunidad bacteriana se analizó por pirosecuenciación de fragmentos del gen ARNr 16S (pyrotags). Las 450.868 lecturas obtenidas a partir de los sedimentos originales y los tratamientos fueron procesadas utilizando el programa mothur, alcanzándose coberturas de 64 a 93 %. Además, se estimó por PCR cuantitativa la abundancia del gen phnA1 (gen de la dioxigenasa identificado en Cycloclasticus spp., bacterias marinas degradadoras obligadas de hidrocarburos aromáticos) y el gen ARNr 16S como referencia. Las comunidades de sitios contaminados sufrieron grandes cambios luego del agregado de petróleo crudo, fenantreno y pireno, incrementándose la abundancia de géneros como Cycloclasticus (CC y OR), como así también Sphingopyxis y Nocardioides (OR). Por el contrario, los sedimentos prístinos sólo respondieron al agregado de petróleo crudo, incrementando la abundancia relativa de géneros hidrocarbonoclásticos (Cycloclasticus 21%, Oleiphilus 4.8%), y otros no previamente relacionados a la biodegradación (Teredinibacter 29%). En general, la mayor respuesta correspondió a los genes biomarcadores del género Cycloclasticus, representando en algunos casos más del 50% de las lecturas de pyrotags y hasta 107 copias/g ADN del gen phnA1 (CC expuesto a fenantreno y pireno, OR expuesto a fenantreno). Los valores de abundancia relativa basados en genes biomarcadores filogenéticos y funcionales relacionados con este género correlacionaron fuertemente (Pearson´s r=0.97, p