INVESTIGADORES
ESTRIN Dario Ariel
congresos y reuniones científicas
Título:
Simulación computacional de reactividad química de hemoproteínas
Autor/es:
ESTRIN, D.A.
Lugar:
San Andrés, Colombia
Reunión:
Congreso; Reunión de Químicos Teóricos de Expresión Latina (QUITEL); 2009
Resumen:
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En
este trabajo se presenta una investigación de las bases moleculares
de la unión de ligandos y de la reactividad química de
hemoproteínas empleando técnicas de simulación computacional. En
primer lugar, se analizan los efectos distales, proximales y de las
fluctuaciones térmicas en la unión de ligandos diatómicos al hemo,
empleando una combinación de simulaciones de dinámica molecular
clásica (MD) y cálculos híbridos cuántico-clásicos (QM-MM). La
relación entre las propiedades estructurales y las energías de
unión y constantes cinéticas se discuten para varias proteínas
seleccionadas: mioglobina, leghemoglobina, minihemoglobina de C.
Lacteus, hemoglobina de Ascaris, etc.
En
segundo lugar, presentaremos un estudio de la relación entre la
migración de ligandos y la dinámica proteica obtenida a través de
simulaciones de MD clásicas en combinación con esquemas de
muestreo avanzados. Estas técnicas permiten obtener información
acerca de perfiles de energía libre y sitios de almacenamiento.
Resultados para la hemoglobina truncada N de M. Tuberculosis,
proteína crucial en el mecanismo de patogenicidad del
microorganismo, se mostrarán como ejemplo ilustrativo en el que se
sugiere un novedoso mecanismo dual de migración de los ligandos NO y
O2 diseñado para una eficaz detoxificación del NO por la proteína
oxigenada.
Finalmente,
mostraremos un análisis de las bases moleculares de la
hexacoordinación endógena en neuroglobina humana, que sugiere que
la flexibilidad del loop CD juega un rol crucial en la determinación
de las propiedades de unión de ligandos.