Caracterización genómica de la diversidad de patógenos antiguos en Patagonia Central Argentina durante el periodo 6000- 100 años AP

ALVAREZ GALLEGO FLORENCIA, CARRILLO-OLIVAS L , GARFIAS-MORALES E BRAVO-LÓPEZ MJ, MILLAN G, SUBY JA , ÁVILA-ARCOS MC, PAROLIN ML

Cuernavaca México

Congreso; The Mexico Population Genomics Meeting 6 (MexPopGen6); 2023

UNAM

La información molecular de infecciones endémicas encazadores-recolectores en Patagonia antes y después de la colonizacióneuropea es limitada. Este estudio propone brindar datos sobre la detección deespecies de microorganismos presentes en esta región en un transecto de 6mil años. Para ello, se procesaron 56 muestras de restos humanos decazadores-recolectores de la Patagonia septentrional, se incluyeron piezasdentales y huesos de un mismo individuo con y sin evidencias patológicas.Las lecturas no mapeadas al genoma humano se clasificarontaxonómicamente y se compararon utilizando Kraken2 y Kraken-Uniq paradescartar falsos positivos. Con el fin de diferenciar patógenos del resto de losmicroorganismos presentes en el sedimento circundante, se analizó lapresencia de factores de virulencia por medio de la base de datos VFDB. Losprimeros resultados revelaron hasta un 42% de ADN humano endógeno y sedetectaron especies de bacterias con factores de virulencia asociados a laperiodontitis, como Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola,Fusobacterium nucleatum, Prevotella intermedia, especies del géneroTenerella, y especies de bacterias asociadas a osteomielitis, como Escherichia coli, especies del género Staphylococcus, y Haemophilus influenzae. Una vezdefinidos los patógenos antiguos de interés, se procederá a la captura yenriquecimiento genoma de dichas especies. Estos resultados, en conjuntocon estudios de paleopatología e isótopos estables, permitirán discutir latransmisión de diversas patologías asociadas a la dieta y a los posterioreseventos migratorios propuestos en la región central de Patagonia realizandoanálisis filogenéticos