DISEÑO DE CEBADORES DEGENERADOS PARA LA AMPLIFICACIÓN DEL GEN cbhI EN HONGOS DE PUDRICION BLANCA

GIORGIO E; CONIGLIO, ROMINA; ABATE, CARLOS; ZAPATA, PEDRO

Viña del Mar, Chile

Congreso; XIV CONGRESO LATINOAMERICANO DE GENÉTICA; VII CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE MUTAGÉNESIS,CARCINOGÉNESIS Y TERATOGÉNESIS AMBIENTAL; XLII CONGRESO DE LA SOCIEDAD DE GENÉTICA DE CHILE; XXXIX CONGRESO DE LA SOCIEDAD ARGENTINA DE GENÉTICA; 2010

Asociación Latinoamericana de Genética

Los desperdicios agrícolas y los materiales forestales contienen altos niveles de lignocelulosa, sustancia abundante en la naturaleza. Ellos constituyen una fuente renovable de celulosa, que puede ser convertida a etanol por hidrólisis enzimática. La hidrólisis de la celulosa está mediada por endoglucanasas y celobiohidrolasas. El objetivo de este trabajo fue desarrollar cebadores degenerados para amplificar el gen que codifica la enzima celobiohidrolasa I. Para ello, fueron utilizadas las siguientes herramientas bioinformáticas: T-coffee versión_8.14, NEBcutter V2.0, FastPCR V6.0 y la base de datos GenBank. Once secuencias aminoacídicas correspondientes a celobiohidrolasas I de basidiomicetos fueron obtenidas de la base de datos y alineadas usando T-coffee. Luego de reconocer las regiones conservadas y examinar el código genético, se diseñaron cuatro cebadores degenerados, los cuales fueron evaluados con el programa Fast-PCR. Con el objetivo de una clonación posterior, se usó NEBcutter para realizar el análisis de secuencias de restricción in silico. Las secuencias correspondientes a las enzimas NcoI y SpeI fueron adicionadas a los cebadores sentido y anti-sentido respectivamente.