ACCIÓN DE EXTRACTOS VEGETALES SOBRE LA MIOCARDIOPATÍA CHAGÁSICA

GÓMEZ CHÁVEZ JOSÉ LEONARDO; CONTI, GERMÁN ANDRES; PEREZ, ERNESTO RAFAEL ; ANGELINA, EMILIO LUIS; PERUCHENA, NÉLIDA MARÍA

San miguel de Tucuman

Simposio; 7mo Simposio Argentino de Jóvenes Investigadores de Bioinformática; 2022

Argentine Regional Student Group

La etapa crónica de la enfermedad de Chagas (ECh) se caracteriza por una intensa miocardiopatía causada por la infección con el parásito Trypanosoma cruzi. Extractos de Cymbopogon citratus (CC) han demostrado ser efectivos en esta etapa reduciendo los nidos de amastigotes e infiltrados inflamatorios en el tejido cardíaco de ratones.En este trabajo se emplearon herramientas bioinformáticas en conjunto con herramientas quimioinformáticas y de cribado virtual para entender el mecanismo de acción a nivel molecular del extracto de C. citratus en la miocardiopatía chagásica.Objetivos: ● Comprender los mecanismos moleculares de la acción antiinflamatoria del extracto de CC en la miocardiopatía chagásica● Priorizar los genes de las principales vías biológicas asociadas a ECh mediante la construcción de una red de interacción de proteínas (PPI)● Determinar los probables blancos de acción de los compuestos de CC por medio de Docking inverso. Materiales y métodos: Se utilizó el dataset GSE41089 constituido por datos de expresión génica en corazón de ratones infectados con T. cruzi versus control disponible en NCBI-GEO.El procesado, expresión diferencial, enriquecimiento de Ontología génica (GO), pathways e interacciones proteína-proteína (PPI) fueron obtenidos con Oligo, LIMMA, TopGO, SPIA ySTRINGdb respectivamente, disponibles en Bioconductor(http://www.bioconductor.org).Los alineamientos de secuencias fueron realizados con BLAST implementado en Biopython.Los compuestos de CC fueron obtenidos mediante revisión bibliográfica. El docking molecular fue realizado con Quick-vina y la normalización de los datos (Z-score)siguiendo la metodología de Kim, S .et.al (2018). Las dinámicas moleculares (DM) con AMBER 16. Resultados: El estudio de enriquecimiento funcional del dataset GSE41089 constituido por datos de expresión génica en corazón de ratones infectados con T. cruzi versus control, resultó en un set de genes sobreexpresados (logFold-Change>1 y p-valor ajustado