Anotación funcional del genoma de la cepa RA de Trypanosoma cruzi.

CEPEDA DEAN ALDANA ALEXANDRA; ROBELLO, CARLOS; BERNÁ, LUISA; BUSCAGLIA, CARLOS ANDRÉS; BALOUZ, VIRGINIA

Mendoza

Congreso; XI Congreso de la Sociedad Argentina de Protozoología; 2022

Sociedad Argentina de Protozoología

Trypanosoma cruzi está compuesto por seis linajes evolutivos (TcI a TcVI), cada uno de los cualesincluye múltiples cepas que muestran una gran variabilidad genotípica. Estudios comparativosentre los genomas de T. cruzi disponibles, indican que uno de los factores que más contribuyena su diversidad genética es la amplificación/contracción y/o diversificación de familiasmultigénicas importantes para la interacción con el huésped (por ej, mucinas, trans-sialidasas[TSs], mucin-associated surface proteins [MASPs], etc). Utilizando métodos NGS (nextgeneration sequencing) secuenciamos el genoma de la cepa RA (TcVI); una cepa virulenta endistintos modelos de infección. Basándonos en herramientas bioinformáticas de últimageneración (BLAST, EMBOSS, comandos de Linux, scripts en Python, entre otros) y bases dedatos curadas manualmente, diseñamos algoritmos para la identificación y clasificaciónfehaciente de las familias características de este organismo, realizando así la anotación funcionalde esta cepa. Paralelamente, basándonos en las mismas herramientas, realizamos la reanotación del genoma de la cepa TCC (también TcVI, aunque naturalmente atenuada) ycomparamos el perfil de distintas familias multigénicas entre ambas cepas. A pesar de las clarasdiferencias fenotípicas, nuestros resultados indican que RA y TCC no presentan diferenciassignificativas en el dosaje génico ni en el espectro de variabilidad alélica para distintos gruposde mucinas, TSs y MASPs. Actualmente nos encontramos explorando la posible contribución delos pseudogenes y/o genes quiméricos de estas familias y otros grupos de secuencias (porejemplo, genes hipotéticos, transposones) a la diversidad genética entre estas cepas. Esteproyecto, además de facilitar los estudios básicos y aplicados en la cepa RA, permitirá mejorarnuestro entendimiento acerca de los factores relacionados con la virulencia de este relevantepatógeno regional.