Comparación de la sensibilidad de los cebadores SCYLVF1/R1 e YLS111/462 en la detección del Sugarcane yellow leaf virus por RT-PCR.

BERTANI RP; JOYA CM; HENRIQUEZ DD; FUNES C; PERERA MF; GONZÁLEZ V; CUENYA MI; CASTAGNARO AP

Mendoza

Congreso; IV Congreso Argentino de Fitopatología; 2017

El amarillamiento de la hoja de la caña de azúcar (Sugarcane yellow leaf virus, SCYLV) es una enfermedad de difícil diagnóstico visual, por lo que el diagnóstico serológico o molecular resulta fundamental para prevenir la dispersión del virus. Debido a que los cebadores YLS111/462, utilizados para el diagnóstico por RT-PCR, fallarían en la detección del genotipo CUB, se diseñó el par SCYLVf1/r1. En este trabajo se comparó la sensibilidad de ambos cebadores en la detección del SCYLV y se buscó determinar la presencia del genotipo CUB en muestras SCYLVf1/r1 positivas e YLS111/462 negativas. Se realizó el diagnóstico en hojas de caña de azúcar con el par SCYLVf1/r1; las muestras que resultaron positivas, junto con 20 muestras negativas seleccionadas al azar, fueron amplificadas luego con YLS111/462. Se caracterizó el virus en las muestras que resultaron SCYLVf1/r1 positivas e YLS111/462 negativas. El diagnóstico con SCYLVf1/r1 reveló que el virus estuvo presente en 57 de las 154 muestras colectadas, de las cuales sólo 34 resultaron positivas con el par YLS111/462, mientras que las 20 muestras negativas con SCYLVf1/r1 tampoco amplificaron. En las muestras ScYLVf1/r1 positivas e YLS111/462 negativas, sólo se detectó el genotipo BRA-PER. El par SCYLVf1/r1 resultó más sensible que YLS111/462, sin embargo, la ausencia de amplificación con YLS111/462, en muestras que amplificaron con SCYLVf1/r1, no revelaría la presencia de aislados del genotipo CUB. Este es el primer trabajo donde se comparan ambos pares de cebadores, por lo que resulta una significativa contribución.