Caracterización de secuencias repetitivas en tandem en el genoma de Babesia bovis para el desarrollo de un sistema de marcadores moleculares.

SCHNITTGER, L; CABALLERO, M; PEREZ LLANEZA, A; BARAVALLE, E; MESPLET, M.; SUAREZ, C.; FLORIN-CHRISTENSEN, M

Chascomus. Buenos Aires. Argentina

Otro; XXII Reunión Sociedad Argentina de Protozoología.; 2007

Sociedad Argentina de Protozoología

El genoma del patógeno bovino Babesia bovis ha sido recientemente secuenciado y está siendo explotado para desarrollar medidas de control novedosas. Hemos comenzado con la caracterización de secuencias repetitivas en tandem (TRs) en el genoma completo de B. bovis para (a) identificar peculiaridades en su distribución, frecuencia y estructura y (b) usar esta información en el desarrollo de un sistema de marcadores moleculares. B. bovis tiene 4 cromosomas (chr) y un tamaño de 8 Mb. Los Chr 2 y 3, que contienen 1.75 y 2.6 Mb, fueron analizados con el programa Tandem Repeat Finder utilizando parámetros relajados, hallándose 765 y 1150 TRs, respectivamente. Aquellos con un tamaño de secuencia repetitiva entre 2 y 21 nucléotidos (nt) y un número de copia mayor que 7 fueron considerados adecuados como posibles marcadores (34 para el Chr 2 y 51 para el 3) y fueron mapeados. La mayor parte de los TRs fue encontrada cerca de ambos o uno de los extremos de los Chr 2 y 3, respectivamente. Aproximadamente 15% (chr. 3) y 22% (chr. 2) de los 85 TRs identificados fueron microsatelites (número de nt repetitivos < 6). Esto contrasta con los genomas de eucariotas de otros taxones que en general tienen entre sus TRs una proporción de microsatélites mucho mayor.