Identificación y prevalencia de viroides en la Región Citrícola del Río Uruguay

JORIS, G.; CONTI, G.; GOMEZ, C.A.; REYES CA

Concordia

Congreso; X Congreso Argentino de Citricultura; 2023

Los viroides son patógenos muy pequeños cuyo tamaño oscila entre 246-401 nucleótidos. Constan de una sola molécula circular de ARN, y su estructura está definida por el número y secuencia de nucleótidos que lo componen (5). Según el Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) los viroides que afectan a cítricos son Citrus bent leaf viroid (CBLVd), Citrus dwarfing viroid (CDVd), Citrus viroid V (CVd-V), Citrus viroid VI (CVd-VI), Citrus viroid VII (CVd-VII), Citrus bark cracking viroid (CBCVd), Hop stunt viroid (HSVd) y Citrus Exocortis viroid (CEVd). En Argentina, hasta la fecha se ha reportado la presencia de CEVd, HSVd, CDVd y CBLVd (3;4). Desde el 2019 en INTA Concordia se viene realizando una identificación y caracterización de viroides en la zona citrícola del Río Uruguay. Se recolectaron muestras de los departamentos de Concordia y Federación en Entre Ríos, y departamento Monte Caseros en Corrientes, provenientes desde naranjos (Citrus sinensis) con sintomatología asociada a viroides, principalmente enanismo y descortezado en el pie. Fueron 9 lotes muestreados en total, tomándose 3 muestras de cada uno, incluyendo 1 de planta sin síntoma. Las mismas fueron inoculadas en plantines de Cidra Etrog Arizona 861-S-1 (Citrus medica) mediante injertos de secciones de corteza. Estas plantas se mantuvieron en invernáculo a 28-32ºC durante 5 meses para luego ser analizadas mediante indexing biológico, sPAGE y RT-qPCR. Los plantines de C. Etrog son utilizados por su susceptibilidad y por amplificar naturalmente a los viroides. Para el diagnóstico mediante sPAGE se utilizó el protocolo descripto por Duran-Vila y colaboradores (1988) con algunas modificaciones. Los viroides hallados fueron confirmados por RT-qPCR utilizando primers específicos según Bernad and Duran-Vila (2006). A partir de estos resultados, se identificaron hasta la fecha las especies CEVd, HSVd y CDVd. El 74% de las plantas analizadas estaban infectadas con al menos un viroide o una combinación de ellos. Los porcentajes de aparición de cada viroide, considerando el total de muestras son de 37,04% para CEVd y del 62.96% para HSVd y CDVd. A estos dos últimos siempre se los encontró juntos. Además, las frecuencias de combinaciones de viroides encontradas en la zona citrícola del Río Uruguay, calculadas en relación al total de muestras positivas, son del 50% para HSVd-CDVd, 35% para CEVd-HSVd-CDVd y 15% para CEVd.1-Bernad, L., & Duran-Vila, N. (2006). A novel RT-PCR approach for detection and characterization of citrus viroids. Molecular and Cellular Probes, 20(2), 105–113.2-Duran-Vila, N., Roistacher, C. N., Rivera-Bustamante, R., & Semancik, J. S. (1988). A Definition of Citrus Viroid Groups and Their Relationship to the Exocortis Disease. Journal of General Virology, 69(12), 3069–3080.3-Palacios, M. F. y Figueroa, J. (2019) Primer reporte de los viroides de la curvatura de la hoja y del enanismo de los cítricos en Argentina. IX Congreso Argentino de Citricultura.4-Plata, M. I., Costa, N., Fabiani, A., & Anderson, C. M. (2002). Characterization of Nine Sources of Dwarfing Factors Used in Tree Size Control Trials at Concordia, Argentina. Fifteenth IOCV Conference, 2002—Short Communications5-Umaña Castro, R. (2010). Diagnóstico de CBCVd (Cocadviroide) y CVd-VI (Apscaviroide) en plantaciones citrícolas del Uruguay mediante técnicas de detección basadas en hibridación molecular no isotópica. Tesis de Magíster, Facultad de Ciencias, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay