INVESTIGADORES
FERNANDEZ Maria Elena
congresos y reuniones científicas
Título:
Screening genómico para la búsqueda de regiones candidatas en la determinación genética del score de capa en Brangus
Autor/es:
BALBI, M; BONAMY M; FERNANDEZ ME; ALVAREZ CECCO, P; PRANDO AJ; ROGBERG MUÑOZ A; GIOVAMBATTISTA G
Lugar:
Buenos Aires (virtual)
Reunión:
Congreso; 43º Congreso Argentino de Producción Animal; 2020
Institución organizadora:
Asociacion Argentina de Producción Animal
Resumen:
La raza Brangus está ampliamente difundida en las explotaciones ganaderas del subtrópico, por su conocida adaptación a ambientes calurosos y húmedos. Fue concebida para aprovechar la calidad de carne y fertilidad del Angus, y la adaptación del Brahman. Esta adaptación involucra cambios físicos, conductuales, fisiológicos y morfológicos. En particular, ocurren cambios a nivel del pelaje, mayor pigmentación de la piel, pelo más corto y capa de color claro. Esto se debe a que la mayoría de los mecanismos de intercambio de calor con el medio ambiente (conducción, convección, radiación y evaporación cutánea) ocurren a través de la piel. La genómica estudia cómo los genes influyen sobre un carácter, a través de la variabilidad genética, la expresión génica diferencial, y las interacciones de estos a nivel celular y metabólico. En el marco de un proyecto de estudio de la adaptación del Brangus al estrés calórico, el objetivo de este trabajo consistió en realizar un screening genómico para la búsqueda de regiones candidatas en la determinación genética del score de capa en esta raza.Se evaluaron 90 toros brangus, pertenecientes al establecimiento comercial Fortín Corrales, ubicado en la provincia de Chaco, durante el mes de marzo. Se determinó visualmente el score de capa (escala del 1-7. Turner et al., 1960) y el color de pelo. Brevemente, el score es una escala subjetiva que considera la imbricación, el largo y el tipo de pelo. Además, los animales fueron genotipados con el microarray de mediana densidad 50K ArBos1, en el servicio de genotipado del IGEVET (FCV-UNLP/CONICET). Luego de los filtros de calidad se utilizaron para el análisis 48.408 SNPs. El screening se realizó aprovechando el modelo de estudio de asociación de genoma completo por ventanas ajustado mediante single step GBLUP para la característica score de capa, basados en la metodología propuesta por Wang et al. (2012). Los análisis fueron realizados utilizando la familia de programas BLUPF90, agrupando los marcadores en ventanas de 20 SNPs. Las varianzas utilizadas fueron las reportadas por Porto-Neto et al. (2014) para el score de pelo en animales compuesto tropical. En la Figura 1 se muestra el Manhattan plot por ventanas de 20 SNPs y por cromosoma. El resultado del screening mostró señales significativas entre las posiciones 47,7 y 54,9 MB del cromosoma 5. Si bien las estimaciones y la significancia deben ser tomadas con cautela, dado el número de datos fenotípicos utilizados, esta región ha sido reportada previamente mediante análisis de huellas de selección en razas compuestas de origen índico. Porto Neto et al. (2014) la asociaron a medidas de peso, condición corporal y color de capa, mientras Naval Sánchez et al. (2020) detectaron una huella de selección entre 47,6 y 48,1 Mb del mismo cromosoma. Esos autores observaron que los SNPs están fijados en las poblaciones índicas estudiadas; y ubicaron genes, como HELB, LEMD3, HMGA2, IRAK3, entre otros, que han sido previamente asociados asociados a peso, score de prepucio y características reproductivas. Nuestros resultados se suman a un número de trabajos que asocian a regiones del BTA5 con características relacionadas a la adaptación y sustenta el rol de este cromosoma en la adaptación a los ambientes tropicales. En particular, este hallazgo podría estar relacionado con mecanismos metabólicos adaptativos relacionados a la imbricación, el largo y el tipo de pelo.Los resultados de este estudio, aunque preliminares, se suman a los reportados por otro grupos respecto de la importancia del BTA5 en la adaptación de los bovinos a ambientes de clima subtropical y tropicales. La región encontrada es candidata para estudios posteriores de re-secuenciación y/o expresión génica que permitan demostrar su influencia y los mecanismos subyacentes