De la Microscopía a la Biología Molecular

GIUSIANO G

Buenos Aires

Conferencia; XII Congreso Argentino de Microbiología, VI Congreso de la Sociedad Argentina de Bacteriología, Micología y Parasitología Clínica – SADEBAC, I Congreso de Microbiología Agrícola y Ambiental – DiMAyA.; 2010

Para la identificación de especies de hongos no existe un procedimiento o característica “gold standard” que permita diferenciar fehacientemente una especie de otras, por el contrario, se necesita la combinación de datos de secuencias de ADN,  características morfológicas, fisiológicas y datos ecológicos. Sólo aplicando el set de estas características podremos ser capaces de identificar y más aun definir una especie nueva. Las características morfológicas son muchas veces variables y necesitan la combinación con otras caracteriticas. En el caso de los datos de secuencias, ITS ha sido sugerido por su amplio uso, pero las secuencias ITS muestran pequeñas, o no muestran, variaciones entre especies estrechamente vinculadas. Para la descripción de una especie se recomienda examinar multiples (al menos 2 o 3) y variables locus (secuencias de genes?) (ITS; B-tubilina, actina, calmodulina, y otros intrones ricos en genes que codifican proteinas. En el caso de extrolitos se sugiere un set de 4-8 compuestos. La dificultades relacionadas al estudio de datos de secuencia de genes incluyen el hecho que no todos tiene acceso a la PCR y secuenciación. Por otro lado, no se sabe aún si otros genes son más informativos. Los datos de secuenciación de todos los hongos no están disponibles o no están estudiados y muchos de los que están en el Gen Bank son datos errónes