METAGENÓMICA VIRAL DE EPITELIOS CUTÁNEOS: EVALUACIÓN DE MÉTODOS PARA ESTUDIOS DE VIROMA

CERRI, AGUSTINA; BERTAINA, CAROLINA; BOLATTI, ELISA M; GARCÍA REY, JULIETA; ZOREC, TOMAZ M; CASAL, PABLO E; HOSNJAK, LEA; PICCIRILLI, GUSTAVO; MOLTENI, ANA; MARIO POLJAK; GIRI ADRIANA A

Rosario

Jornada; XVI Jornadas de Ciencias, Tecnologías e Innovación de la UNR; 2022

Universidad Nacional de Rosario

Introducción: La flora microbiana de la piel juega un rol crucial en el mantenimiento de laintegridad cutánea y funciona como una barrera externa crítica. Distintas investigacioneshan demostrado que la disbiosis del microbioma cutáneo se encuentra relacionada con eldesarrollo de diversas patologías de la piel, incluyendo la psoriasis. Los virus tienen ungran potencial para modular el estado de salud de la piel; sin embargo, el conocimientosobre las comunidades virales cutáneas y las relaciones con sus huéspedes es escaso.Objetivos: Establecer una metodología adecuada de metagenómica viral para el estudio delviroma cutáneo en salud y enfermedad.Metodología: Se evaluaron 3 protocolos para el procesamiento de muestras de piel: A)purificación de ADN total; B) filtración + ultracentrifugación + purificación de ADN; y C)purificación de partículas virales. Para ello, se prepararon 3 pooles de hisopados de pielrecolectados de 30 individuos sin patologías cutáneas y cada pool fue procesado con losprotocolos A, B o C; el ADN extraído en cada caso fue sometido a secuenciación de altorendimiento (Hiseq 2000, Illumina). Mediante diversas herramientas bioinformáticas, laslecturas obtenidas fueron sometidas a análisis de calidad y clasificación taxonómica conbases de datos virales.Resultados: En total se obtuvieron 1.376.217 lecturas (A: 540.546; B: 349.762; C:485.909) con parámetros de calidad adecuados, de las cuales 116.265 (A: 20.418; B:95.621; C: 226) mapearon con 36 familias virales diferentes (A: 28; B: 22; C: 10). Elmétodo B fue el más efectivo para obtener la mayor cantidad de secuencias virales. Lasfamilias Papillomaviridae, Genomoviridae, Poxviridae y Arteriviridae fueron las másfrecuentemente encontradas entre las familias de virus que infectan vertebrados.Conclusión: Este trabajo aporta información relevante para la selección de protocolosadecuados de procesamientos de muestras cutáneas para estudios orientados a conocer elrol del viroma en patologías de la piel como la psoriasis.Financiamiento: ASaCTei (IO-2019-257), ANPCyT (PICT 2020-00571)