Estudio del efecto antiinflamatorio de los componentes de C. citratus mediante el Cribado Virtual sobre la red biológica de la enfermedad de Chagas

GOMEZ CHAVEZ, JOSE LEONARDO; CONTI, GERMAN; ANGELINA, EMILIO; PERUCHENA, N. M.

virtual todas

Simposio; Simposio de Estudiantes Hispanohablantes de Bioinformática y Biología Computacional (SEH2_Bioinfo); 2022

RSG Argentina, RSG Ecuador, RSG España, RSG Venezuela, RSG Colombia, RSG Chile, RSG Peru, RSG Costa Rica, RSG México

Introducción: La enfermedad de Chagas (Ech) causada por Trypanosoma cruzi dispone de tratamientos poco efectivos durante la fase crónica, etapa donde extractos de Cymbopogon citratus (CC) han demostrado ser efectivos. Objetivo: Comprender los mecanismos moleculares de la acción antiinflamatoria del extracto de CC en la miocardiopatía chagásica, mediante docking molecular sobre los Hubs de las redes de interacciones proteína-proteína (PPI) asociadas a la ECh. Materiales y métodos: Se utilizó el dataset GSE41089 constituido por datos de expresión génica en corazón de ratones infectados con T.cruzi. El procesado, expresión diferencial, enriquecimiento de Ontología génica (GO) y pathways e interacciones proteína-proteína (PPI) fueron obtenidos con Oligo, LIMMA, TopGO, SPIA y STRINGdb respectivamente, disponibles en Bioconductor. Las estructuras fueron obtenidas de Protein Data Bank y AlphaFold DB, mientras que los compuestos de CC mediante revisión bibliográfica. El docking molecular fue realizado con Autodock-vina y las dinámicas moleculares (DM) con AMBER16. Resultados: El enriquecimiento funcional de genes sobreexpresados del dataset GSE41089 (logFold-Change>1 y p-valor ajustado