Análisis transcriptómico de sorgo de Alepo resistente a glifosato

ULRICH, N; MUÑIZ PADILLA, E; CORACH, A; HOPP, HE; LIJAVETZKY, D; TOSTO, D

Buenos aires

Simposio; XIV SIMPOSIO REDBIO ARGENTINA; 2023

Redbio Argentina

La resistencia a herbicidas en malezas es una de las problemáticas agrícolas de mayor importancia en la actualidad, con una pérdida del 10% del rendimiento total de los granos, por lo cual el poder dilucidar los mecanismos moleculares por los cuales las malezas son resistentes es de relevancia. Las malezas pueden sobrevivir a los herbicidas debido a una variedad de mecanismos que pueden ser divididos en dos categorías: asociados al sitio blanco (TSR) y no asociados al sitio blanco (NTSR). Los mecanismos TSR involucran mutaciones en los genes que codifican las enzimas blanco del herbicida o el incremento de la enzima por duplicación génica o aumento de la expresión, mientras que los mecanismos NTSR incluyen translocación reducida, transporte vacuolar o degradación metabólica del herbicida. Los aspectos más riesgosos de los mecanismos NTSR es que pueden estar asociados a resistencia cruzada, la cual es impredecible y no 195 especifica para un modo de acción determinado. El RNAseq ha sido adoptado por la comunidad que estudia las malezas, dado que permite comparar el transcriptoma entre biotipos resistentes y susceptibles, esta comparación posibilita la detección de diferencias en la expresión génica, resultando en una lista de genes diferencialmente expresados (DEGs) El objetivo del presente trabajo es el análisis de la expresión diferencial de genes ante el tratamiento a glifosato en biotipos susceptibles y resistentes de sorgo de Alepo. Para lo cual se aplicó a ambos biotipos una dosis recomendada de marbete y se recolecto material previo a la aplicación y a las 72 horas post aplicación; el ARN fue extraído a partir de hojas de tres replicas biológicas independientes y se prepararon 12 genotecas con el Kit TruSeq Stranded mRNA Sample Preparation. La secuenciación de las bibliotecas fue single-end 1x75 pb en un equipo Next Seq HO 500. Entre los DEGs en ambos biotipos ante el tratamiento a glifosato se encontraron 14 Cit P450, 5 transportadores ABC, 1 glicosiltransferasa, 1 glucosiltransferasa, 1 catalasa, 2 peroxidasas, 1 transportador catiónico, 1 oxidoreductasa y 1 fosfoenolpiruvato carboxilasa Se realizó la búsqueda de los genes DEGS de la intersección Hasl 10_OV to y Hasl 172_OVt72, de los 911 genes de la intersección, 456 no están anotados en el genoma de referencia, entre los genes anotados se observaron dos genes de aldo ceto reductasa, un gen de una Transposasa vegetal perteneciente a la familia Ptta/En/Spm Además, se encontraron 3 genes de Cit-P450, 4 GST y un gen de transportadores ABC (subfamilia PDR). A medida que se identifiquen genes NTSR específicos, se podrá avanzar en el conocimiento de regulación de estos y la relación entre el genoma de la maleza y su fenotipo de resistencia. Estos conocimientos servirán para diseñar programas de gestión de malezas específicos para diferentes tipos de mecanismos de resistencia