Caracterización molecular de plásmidos en Escherichia coli mcr-1-positiva recuperada de roedores y cerdos

JOHANA E. DOMÍNGUEZ; FLORENCIA MARTINO; ROSARIO LOVERA; NATALIA A. CASANOVA; CHRISTINE SEAH; REGINO CAVIA; ROBERTO G. MELANO; DIEGO FACCONE; MARIANO E. FERNÁNDEZ MIYAKAWA

Quito

Congreso; XXVI Congreso Latinoamericano de microbiología 2023, VII Congreso Ecuatoriano de Microbiología; 2023

La resistencia antimicrobiana (RAM) se ha convertido en un problema creciente que afecta tanto a la salud pública, a la sanidad animal, e influye en la interfaz hombre-animal-ambiente. Los mamíferos silvestres, entre ellos los roedores, pueden interactuar con los animales de producción y servir como reservorios de bacterias y de genes de RAM. Además, pueden funcionar como vectores y diseminar las bacterias resistentes en la cadena alimentaria y en el ambiente. Se han descripto Escherichia coli (EC) en humanos y animales como el principal hospedador de gen mcr-1, responsable del fenotipo resistente a colistina (COL-R) mediada a por plásmidos. Esta polimixina es un antimicrobiano de último recurso para infecciones por bacterias gran-negativas multirresistentes en humanos. El objetivo de este trabajo fue caracterizar los plásmidos portadores de mcr-1 en EC obtenidas de roedores y cerdos que cohabitan las granjas de producción, y estudiar la posible transmisión entre ellos. Se aislaron 145 EC COL-R desde muestras de materia fecal de cerdos y de contenido intestinal de Rattus norvegicus, desde 4 granjas de producción de Buenos Aires. Se evaluaron en 48 EC seleccionadas al azar, las relaciones filogenéticas (PFGE), el contenido plasmídico (S1/PFGE); y los genomas bacterianos (secuenciación completa mediante las plataformas Ilumina y Nanopore). Los aislamientos provenientes de ambos tipos de animales de una misma granja, no mostraron relación filogenética entre sí. Sin embargo, se observaron plásmidos de tamaños similares entre las EC de diferentes orígenes. La secuenciación de genomas permitió la localización de los genes mcr-1 en plásmidos tipo IncX4 e IncI2, de tamaños compatibles con los descriptos por S1/PFGE. Al analizar los replicones IncX4 (roedor y cerdo, granja 1) ambos presentan la misma variante, mcr-1.1, con un entorno genético idéntico, salvo por secuencia ISVsa5. Los replicones del grupo IncI2, presentaron variantes y entornos de mcr-1 diferentes (roedor y cerdo, granja 3). El análisis plasmídico permitió concluir que existe transmisión horizontal de mcr-1 entre EC resistente a colistina entre cerdos y roedores dentro de un establecimiento. El control de los roedores y su impacto como reservorio de bacterias resistentes debe considerarse como una medida necesaria para la bioseguridad en las granjas y en el ambiente productivo.