Estudio comparativo de estructura y dinámica de polímeros de VBT:VBA (1:1 y 1:4) por Dinámica Molecular y Dicroismo Circular

S. GARAY; A. FUSELLI; D. M. MARTINO; D.E. RODRIGUES

Buenos Aires

Congreso; Reunion de la Sociedad Argentina de Biofísica; 2011

SAB

Los polímeros biomiméticos de vinil bencil Timina (VBT) se han inspiradoen las interacciones entre bases nitrogenadas que ocurren en procesosdegenerativos del ADN y su posibilidad de reversión por enzimasespecíficas de organismos vivos. Para evitar el empleo de solventesorgánicos en su proceso de polimerización se copolimerizan conmonómeros hidrofílicos como cloruro de 4-vinil bencil trietilamonio(VBA). La aplicación tecnológica de estos polímeros ha precedido a losestudios básicos necesarios para racionalizar su comportamiento y mejorarsus prestaciones. En este trabajo se presenta un estudio de la influencia de larelación molar de copolimeración VBT:VBA sobre la estructura de cortoalcance que adoptan las cadenas del polímero. Se han realizadosimulaciones computacionales de Dinámica Molecular sobre cadenas finitasy también experimentos de Dicroismo Circular (DC) en muestras acuosascon las razones molares simuladas. El estudio comparativo de cadenas condistinta estequiometría permite revelar las interacciones relevantes que danorigen a la estructuración de estos polímeros. Las simulaciones se realizaronsobre polímeros de 32 monómeros (VBT:VBA en razón 1:1) y de 35monómeros (VBT:VBA en razón 1:4). Para el caso de la razón 1:1 seencontró que el polímero presenta un 57% de sus monómeros en unaconformación tipo hélice, mientras que para la razón 1:4 este porcentaje caea un 40%. En el primer caso se detectaron apilamientos de los anillos de Tde los residuos (i, i+4), mientras que para la razón 1:4 los apilamientosocurren entre residuos (i, i+5), los más cercanos disponibles. La cantidad deresiduos por giro de hélice es 3,6 para 1:1 y 4.0 para 1:4. Los segmentos dehélice se encuentran interrumpidos por tramos desestructurados. Se observaen todos los casos que la presencia de hélice en un tramo se halla asociada aal menos un monómero de T que posee interacción de apilamiento. Enconclusión la interación fundamental para la estructuración del polímeroson las de apilamiento de T que disminuyen la superficie expuesta alsolvente de estos grupos. Para el caso 1:4 los apilamientos T-T son menosestables que para 1:1. La ausencia de señal en los experimentos de DC escoherente con los resultados de la simulación.