Primer genoma secuenciado de una cepa argentina de Streptococcus agalactiae aislada de un bovino con mastitis

CADONA J.S., L.B. HERNANDEZ, J.R. LORENZO LÓPEZ, A.V. BUSTAMANTE, A.M. SANSO

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Congreso; 48 Congreso Argentino de Genética; 2020

Primer genoma secuenciado de una cepa argentina de *Streptococcus agalactiae* aislada de un bovino con mastitisCadona J.S., L.B. Hernandez, J.R. Lorenzo López, A.V. Bustamante, A.M. Sanso.Laboratorio de Inmunoquímica y Biotecnología, Centro de Investigación Veterinaria de Tandil (CIVETAN), CONICET-CIC-UNCPBA, Facultad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires, Tandil, Argentina. E-mail: msanso@vet.unicen.edu.ar*Streptococcus agalactiae* es un importante patógeno causante de mastitis clínica y subclínica en bovinos, lo cual impacta en la salud animal y en la producción láctea. Es también un patógeno humano que causa infecciones graves, principalmente en neonatos, ancianos e inmunosuprimidos. En el marco de un proyecto que comprende el análisis genómico comparativo de cepas de *S. agalactiae* y con el objetivo de identificar regiones genómicas que podrían ser marcadores predictivos de virulencia, se secuenció el genoma completo de una cepa argentina de *S. agalactiae* aislada de un bovino con mastitis. La secuenciación del genoma se realizó mediante la plataforma MiSeq (Illumina). A partir de los datos obtenidos se determinó el secuenciotipo (ST) mediante *Multilocus sequence typing* (MLST). Se halló un nuevo alelo en el *locus sdhA* identificado como *sdhA*-153 por la base de datos PubMLST. Consecuentemente, el aislamiento presentó un ST también novedoso, ST-1640. Los datos de secuenciación se cargaron en la plataforma web Galaxy. Las *reads* fueron ensambladas *de novo* usando SPAdes. Como resultado, el genoma se ensambló en 150 *contigs* con un valor N50 de 39.265 pb y una longitud máxima de *contig* de 104.508 pb. El genoma presentó una longitud aproximada de 2,3 Mb con un contenido de G+C de 35,61%. Se utilizó Prokka para la anotación del genoma y se predijeron 2.312 genes que codifican proteínas. Estos resultados constituyen los primeros datos genómicos de una cepa argentina de *S. agalactiae* de origen bovino, e informan de la circulación de un clon exclusivo de Argentina.