PERSONAL DE APOYO
CRESPI Julian Alejandro
congresos y reuniones científicas
Título:
Análisis simultáneo de filiación, condiciones genéticas y caracteres cualitativos mediante Targeted-NGS en perros
Autor/es:
ARIZMENDI A; RUDD GARCES G; CRESPI J A; OLIVERA H; PERAL GARCIA P; GIOVAMBATTISTA G
Lugar:
Ciudad de Buenos Aires
Reunión:
Congreso; XLVIII Congreso Argentino de Genética; 2020
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Genetica
Resumen:
ANÁLISIS SIMULTÁNEO DE FILIACIÓN, CONDICIONES GENÉTICAS Y CARACTERES CUALITATIVOS MEDIANTE TARGETED-NGS EN PERROSArizmendi A.1, G. Rudd Garces1, J.A. Crespi1, L.H. Olivera1,P. Peral García1, G. Giovambattista1. 1Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET-CONICET-FCV-UNLP), LA Plata, Buenos Aires, Argentina.analiaarizmendi.mv@gmail.comLa secuenciación de nueva generación (NGS) esuna herramienta eficaz para analizar filiación,detectar condiciones genéticas y estudiar caracterescualitativos. El targeted-NGS tiene como objetivolograr el ?enriquecimiento dirigido? a las regionesdel genoma de interés (reduce cobertura y aumentaprofundidad), y reducir costos en comparación conla secuenciación del genoma completo (WGS). Elpropósito del trabajo fue evaluar esta tecnologíacomo una alternativa a WGS. A partir de 95 muestrascaninas (76 doberman y 19 caniches toy), generamosinformación genotípica de 387 marcadores utilizandola versión beta del kit AgriSeqTargeted GBS (ThermoFisher, EE.UU.). Se calculó el poder de exclusiónde 228 SNPs de parentesco con el software Cervus3.0. El análisis de paternidad de los animales conpedigrí demostró una asignación correcta del 91%(LOD
