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Rotavirus es la principal causa viral de diarrea en terneros neonatos. Posee un genoma de ARNdc segmentado rodeado por una triple cápside proteica. Las proteínas VP4 y VP7 conforman la cápside externa y según su variación los Rotavirus Grupo A se clasifican en P y G tipos. Los genotipos P11 asociado a G10 y variantes de G6 son de importancia epidemiológica en nuestro país en los rodeos de leche. El objetivo de este trabajo fue conocer la dinámica poblacional y estudiar la presencia de diferentes linajes filogenéticos de los genotipos P11 y G10. Para ello se secuenciaron los genes de VP4 yVP7 de cepas de rotavirus argentinas detectadas en el periodo 1997-2008 y se realizaron análisis filogenéticos utilizando diferentes criterios de optimalidadPara el genotipo G10 por distancias se pudieron observar 4 linajes. El valor de cut-off observado para la definición de los linajes fue del 13%. La mayoría de las cepas argentinas se agruparon en uno de los linajes, mientras que la cepa vacunas B223 P[11]G10 se encontró en otro linaje alejado. La diferencia entre el linaje de las cepas argentinas y el linaje de B223 (cepa vacunal) es del 14,8%. Para el genotipo P[11] se observaron 4 linajes potenciales; las cepas argentinas se ubicaron en dos linajes relacionados entre si. Nuevamente, se observó que el P tipo de la cepa B223 está alejado de las cepas locales circulantes. Esto indicaría que las cepas de campo locales están alejadas de la cepa vacunal y sugeriría la necesidad de realizar estudios para determinar si es necesario actualizar la vacuna utilizada. También se pudo observar una asociación geográfica de cepas provenientes de Argentina. Estudios filogenéticos utilizando otros criterios de optimalidad se están llevando a cabo para confirmar estos resultados.

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