ESTUDIO FILOGENÉTICO DE VP7, VP8, NSP4 Y NSP5 DE ROTAVIRUS EQUINO DE ARGENTINA.

MIÑO, SAMUEL; GARAICOECHEA, LORENA; BARRANDEGUY, MARIA; PARREÑO, VIVIANA

Huerta Grande, Córdoba, Argentina

Jornada; XXIX Reunión Científica Anual SAV; 2009

SAV-AAM

Los virus del género Rotavirus (RV) grupo A se clasifican en genotipos de acuerdo a las características de los 11 segmentos de ARN que componen su genoma. En base a los antígenos neutralizantes VP7 y VP4 se clasifican en G (glicoproteína) y P (proteasa sensible) tipos respectivamente. El gen NSP4, que codifica para la enterotoxina viral, permite clasificarlos en E tipos y el gen de NSP5 en H tipos.  Estudios previos realizados en nuestro laboratorio han permitido identificar los genotipos G3 y G14 asociadas a P4[12], como prevalentes, en brotes de diarrea en potrillos de Argentina. Se detectó también una única cepa con un genotipo no descripto en equinos, P[3]G3, en 2008. No hay datos con respecto a los E y H tipos. El objetivo del presente trabajo fue analizar filogenéticamente las secuencias de VP7, VP8, NSP4 y NSP5 de RV equinos detectados en Argentina en los últimos años. Se analizaron 26 secuencias de VP7, 12 secuencias de un fragmento de VP4 (VP8), 10 secuencias de NSP4 y 12 secuencias de NSP5. Productos de amplificación por PCR de cada segmento genómico estudiado fueron secuenciados y analizados por Máxima Parsimonia, Máxima Verosimilitud y Distancia. Se determinó la existencia de un linaje monofilético . para G3 y G14 dentro de P[12] con un 97% de homología. Asimismo las secuencias de NSP4 (E tipos) y NSP5 (H tipos) también se agruparon en un único grupo monofilético. El genotipo P[3]G3 detectado se agrupó con cepas G3 equinas y caprinas, con P[3] de simios, caprinos, caninos y felinos y con E[3] de simios, humanos y caninos. Los análisis realizados muestran una correlación de los G y P-tipos detectados en nuestro país con los descriptos para la especie en otras partes del mundo. Los E tipos (NSP4), en cambio, forma un grupo geográfico junto a cepas de rotavirus de guanacos y bovinos de Argentina. Contrariamente los H tipos (NSP5) forman un grupo monofilético, que podría constituir un nuevo linaje.   El análisis realizado para el genotipo P[3]G3-E[3] indicaría que es el producto de recombinaciones.