ANÁLISIS DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA DEL COMPLEJO PRINCIPAL DE HISTOCOMPATIBILIDAD BOVINO MEDIANTE UN ARREGLO DE SNPS

GOSZCZYNSKI DE; FERNÁNDEZ ME; ROGBERG MUÑOZ A; LIRÓN JP; MORALES DURAND H; POSIK DM; CARINO MH; PERAL GARCIA P; GIOVAMBATTISTA G

Mar del Plata

Congreso; XLIV Congreso Argentino de Genética; 2015

Sociedad Argentina de Genética

El Complejo Principal de Histocompatibilidad (MHC) bovino es una región cromosómica de aproximadamente 21.984 Kb que incluye genes que cumplen un rol central en la respuesta inmune, y por lo tanto, en los mecanismos de resistencia/susceptibilidad a enfermedades infecciosas y autoinmunes. Es por esta razón que el estudio de la estructura y variabilidad del MHC (denominado BoLA en bovinos) es de gran interés para las ciencias biológicas. En el presente estudio se analizaron 5.585 SNPs en 185 animales correspondientes a seis razas bovinas mediante la tecnología Axiom. Se estimaron los valores de callrate, frecuencia promedio del alelo menor (MAF), heterocigosidad esperada (He), bloques de ligamiento (LD) y distancia promedio entre marcadores. Los resultados obtenidos mostraron un valor promedio de callrate de 99,48 (26,50 a 100) para los marcadores utilizados. El valor de MAF resultó de 0,23 (0 a 0,5), resultando en un valor de He de 0,31 (0 a 0,616). El análisis de LD permitió identificar 1.165 bloque de ligamiento con un tamaño que varió entre 2 y 29 marcadores, siendo la distancia promedio entre marcadores de 3.937 Kb. Según lo esperado, estos valores variaron considerablemente cuando las razas se analizaron en forma independiente. Los análisis realizados pusieron en evidencia que los marcadores utilizados presentan suficiente información, tanto en razas taurinas como cebuinas, para futuros estudios de variabilidad genética del BoLA y de asociación con caracteres sanitarios y de producción.