Variación de secuencias repetitivas en genomas de especies de Drosophila

MENSCH JULIÁN; BARENBAUM PABLO; MIQUET LEANDRO; SERRA FRANCOIS; DOPAZO HERNÁN; BECHER VERÓNICA; HASSON ESTEBAN

Buenos Aires

Congreso; Primera Reunión de Biología Evolutiva del Cono Sur; 2009

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales_UBA

La evolución del genoma es un de los tópicos más debatidos e históricamente controversiales en biología evolutiva. En particular, la variación estructural en el número y composición de secuencias repetitivas constituye una de las fuentes de variación genética mejor estudiadas desde diversos enfoques experimentales. La reciente secuenciación de diversos genomas de Drosophila constituye un excelente modelo para el estudio de la evolución de las secuencias repetitivas a escala genómica. En este contexto, nuestro estudio tiene como objetivo la identificación y caracterización de secuencias repetitivas en genomas del género Drosophila. La metodología empleada consistió en usar un algoritmo de búsqueda de repeticiones exactas de largo arbitrario utilizando como fuente de variación las secuencias genómicas de 12 especies diferentes del género Drosophila. Los resultados indicaron un patrón de repeticiones de una variada composición y diversidad,  aún incluso entre linajes cercanamente emparentados. Sin embargo, pese a la gran diversidad de secuencias repetitivas, en la mayoría de los genomas, el largo de las repeticiones con mayor frecuencia resulta de secuencias con longitudes menores a 20 pares de bases. Aún así, se encontraron repeticiones cuyas longitudes resultaron ser mayores a los 5 kb, lo que evidencia la enorme fuente de variación genética atribuible a este tipo de variabilidad estructural en linajes de reciente cladogénesis.